Applied Biosystems Axiom 蘋果基因分型陣列是我們 Axiom 農(nóng)業(yè)基因組學基因分型解決方案的組成部分，其所含的靶標基因組 DNA 均在 GeneTitan 多通道儀器上制備和處理。該自動化過程包括將 gDNA 與該高通量微陣列雜交，然后進行染色、洗滌、成像和輸出基因分型數(shù)據(jù)以供進一步分析。
Axiom 蘋果基因分型陣列有48,139個蘋果屬 SNP。該陣列是與 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他國際合作伙伴合作設計的。該陣列使用一個先前進行基因分型的不同品種組合以及一個野生蘋果屬種質組合進行設計。
該陣列的設計包括以下內容：
? 向后兼容的一組 SNP（7,711個），這些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 陣列和 Applied Biosystems Axiom 480K 陣列上準確、可靠地聚類
? 采用單倍型塊策略使每 125 kB 中一個 10 kB 窗口包含8個 SNP，均勻覆蓋 HFTH1 全基因組序列
? 針對重要性狀的經(jīng)驗證 SNP
? 專門針對蘋果屬山荊子、西府海棠、東方莢果蕨、八枝海棠、新疆野蘋果和歐洲野生蘋果的 SNP
? 用于檢測 S 等位基因的一組 SNP
該陣列還具有 384HT 規(guī)格。
所需產(chǎn)品
GeneChip Commａnd Console 軟件
GeneTitan 多通道儀器
Axiom Analysis Suite 軟件
Axiom 長格式導出工具 (AxLE)
Axiom 蘋果基因分型陣列有48,139個蘋果屬 SNP。該陣列是與 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他國際合作伙伴合作設計的。該陣列使用一個先前進行基因分型的不同品種組合以及一個野生蘋果屬種質組合進行設計。
該陣列的設計包括以下內容：
? 向后兼容的一組 SNP（7,711個），這些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 陣列和 Applied Biosystems Axiom 480K 陣列上準確、可靠地聚類
? 采用單倍型塊策略使每 125 kB 中一個 10 kB 窗口包含8個 SNP，均勻覆蓋 HFTH1 全基因組序列
? 針對重要性狀的經(jīng)驗證 SNP
? 專門針對蘋果屬山荊子、西府海棠、東方莢果蕨、八枝海棠、新疆野蘋果和歐洲野生蘋果的 SNP
? 用于檢測 S 等位基因的一組 SNP
該陣列還具有 384HT 規(guī)格。
所需產(chǎn)品
GeneChip Commａnd Console 軟件
GeneTitan 多通道儀器
Axiom Analysis Suite 軟件
Axiom 長格式導出工具 (AxLE)
