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小麥Southern雜交分析方法

時(shí)間:2014-3-11閱讀:499
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  預(yù)雜交液的制備:根據(jù)要雜交的膜的數(shù)量配制預(yù)雜交液,每25ml預(yù)雜交液(1~2張膜)的成分組成如下:
  
  H2O15ml
  
  20×SSPE6.25ml
  
  50×Denhardt2.5ml
  
  10%SDS1.25ml
  
  100mg/ml鮭魚(yú)精DNA(緩加)400ml
  
  1、取適量小麥基因組DNA,用適量的限制性內(nèi)切酶消化*(約5U/mgDNA,酶切12h左右),取少量電泳檢測(cè)酶切*性;然后依次用酚:氯仿和氯仿:異戊醇抽提,乙醇沉淀。而后溶解在20mlTEBuffer中;
  
  2、在1%的瓊脂糖凝膠上電泳10~12h,電壓為3V/cm;
  
  3、電泳完畢后,將膠轉(zhuǎn)入EB染色液中,染色10min,紫外燈下檢測(cè)酶切結(jié)果;
  
  4、將膠轉(zhuǎn)入500ml0.25N的HCl中,脫嘌呤15~30min,直至溴酚藍(lán)變黃,用水洗一下;
  
  5、0.4N的NaOH處理20min。與此同時(shí),尼龍膜在超純水中潤(rùn)濕后,在0.4N的NaOH中泡5min以上;
  
  6、將凝膠翻轉(zhuǎn)后放在濾紙橋上,放上一張與凝膠大小相當(dāng)?shù)哪猃埬ぃ℉ybond-N+,Amarsharm),趕除氣泡,在膜上放3層濾紙,與尼龍膜大小相同,趕除氣泡,將凝膠周圍用膠片封好,放上大小相當(dāng)?shù)奈?,壓上約500g的重物,轉(zhuǎn)膜10h以上,其間更換吸水紙;
  
  7、標(biāo)記點(diǎn)樣孔一角,然后放在2×SSC中浸泡10min,并進(jìn)行輕微震蕩。用濾紙吸干,保鮮膜包好,置4℃存放備用;
  
  8、利用HYBAID固相雜交儀進(jìn)行預(yù)雜交、雜交。雜交瓶中根據(jù)膜面積大小,加入10~20ml預(yù)雜交液,預(yù)熱到65℃,然后放入尼龍膜。65℃,預(yù)雜交5~6h;
  
  9、采用Takara公司RandomprimerDNAlabelingkit進(jìn)行探針標(biāo)記,取適量待標(biāo)記的DNA。片段和Randomprimer2ml,加入ddH2O至終體積14ml,95℃變性3min后立即冰浴5min,瞬時(shí)離心。然后在此管中,依次加入:
  
  10×buffer2.5ml
  
  dNTPMixture2.5ml
  
  Klenow酶1ml
  
  α-32P-dCTP5ml
  
  輕輕混勻,37℃反應(yīng)30min~1h。然后65℃反應(yīng)5min,95℃反應(yīng)3min后迅速置于冰上冷卻;
  
  10、將變性后的探針加到預(yù)雜交液中,繼續(xù)于65℃雜交約12h;
  
  11、用2×SSC/0.5%SDS洗膜液于65℃洗膜15min,重復(fù)1次。然后,再用0.2×SSC/0.5%SDS洗膜液于65℃洗膜15min,重復(fù)1次;
  
  12、檢測(cè)雜交信號(hào)與背景情況,直至探測(cè)器探測(cè)的信號(hào)為10個(gè)counters左右,用濾紙吸干雜交膜,用保鮮膜包好,壓磷屏;
  
  13、尼龍膜可以反復(fù)進(jìn)行分子雜交,去除尼龍膜上原雜交探針的方法如下:將0.1×SSC/0.5%SDS洗液加熱到100℃,放入雜交膜,在大于95℃條件下洗5min,重復(fù)3次,將洗好的雜交膜放入2×SSC中漂洗5min,濾紙吸干,保鮮膜包好,4℃存放。
  
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