zui近，在植物進行的一項新研究中，研究人員們以早期工作為基礎，在早期工作中他們將發(fā)生在RNA及RNA結合蛋白質之間的所有相互作用進行編目。這一次，他們僅在細胞核中研究這些相互作用，同時獲得關于核RNA分子結構的數(shù)據(jù)。通過結合這些數(shù)據(jù)集，他們的研究全面分析了可能影響RNA調控過程的模式，這些調控過程發(fā)生在這些分子進入細胞質之前，在那里它們轉化為蛋白質，從而構成一個活的生物體。

    此外，研究人員提供了一個巨大的、公開可用的數(shù)據(jù)集，其他科學家可以用來解決關于他們感興趣的基因及調控機制的問題，從而更好了解從DNA到蛋白質這一行程的動力學。

    研究小組稱，他們開發(fā)出一種方法，可對活生物體中RNA和RNA結合蛋白之間相互關系獲得一個完整的目錄。該技術被稱為PIP-seq，用于蛋白質相互作用譜測序。

    在當前的這項研究中，他們使用常用模式植物擬南芥（Arabidopsis thaliana），標出了所有RBP相互作用位點，也編譯出RNA轉錄子的完整二級結構。*項研究著眼于細胞內的所有RNA，一套被稱為轉錄組的材料，而這項研究卻只著眼于在細胞核。

    通過特別關注細胞核，我們可以避開RNA分子的所有特征——與轉錄成蛋白質的過程相關，這個過程發(fā)生在細胞質中。通過集中研究與RBPs相結合的RNA部分，該研究小組發(fā)現(xiàn)，這些序列在進化史中已經(jīng)變得保守，可能在基因調控機制中發(fā)揮重要的作用。

    兩種關鍵的轉錄調控形式是：可變剪接，其中RNA片段經(jīng)歷了剪切和粘貼過程，以產生可編碼不同蛋白質的新序列；和可變聚腺苷酸化，它會改變一個轉錄子結束和一個腺嘌呤“尾巴"添加的位置，這個過程可以提高RNA分子的穩(wěn)定或降解。