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北京綠源伯德生物科技有限公司
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閱讀:334發(fā)布時(shí)間:2015-7-31
垂體前葉是調(diào)控動(dòng)物產(chǎn)后生長(zhǎng)zui重要的內(nèi)分泌器官,主要是通過控制生長(zhǎng)激素(GH)基因轉(zhuǎn)錄,合成以及分泌。作為動(dòng)物產(chǎn)后生長(zhǎng)研究的理想模型,巴馬小型豬相較于大型豬具有較低的生長(zhǎng)性能和較少的個(gè)體差異。
在本項(xiàng)研究中,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)張永亮教授的課題組采用miRNA芯片和mrna-seq對(duì)巴馬小型豬和長(zhǎng)白豬垂體前葉的miRNA和mRNA表達(dá)譜進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。共檢出222個(gè)miRNAs和12,909個(gè)轉(zhuǎn)錄本,這些miRNAs和mRNAs在兩個(gè)品種中表現(xiàn)出較高的相關(guān)性(r>0.97)。實(shí)驗(yàn)鑒定到41個(gè)差異表達(dá)的miRNA和2,254個(gè)差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本。通路分析表明,在兩個(gè)品種中共有32個(gè)通路存在顯著差異。值得注意的是,兩個(gè)GH調(diào)節(jié)信號(hào)通路——cAMP和三磷酸肌醇(IP3),以及多個(gè)GH分泌相關(guān)的轉(zhuǎn)錄本在巴馬小型豬中顯著下調(diào)。進(jìn)一步地,研究人員使用TargetScan和RNAhybrid預(yù)測(cè)了差異表達(dá)miRNAs(DE miRNAs)和差異表達(dá)基因(DE mRNAs)的相互作用。有趣的是,通過分析它們的變化倍數(shù),發(fā)現(xiàn)大多數(shù)DE miRNA–DE mRNA靶基因?qū)?63.68–71.33%)呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)的表達(dá)模式。研究人員提出了一個(gè)可能的miRNAs,基因,和GH調(diào)控通路之間的網(wǎng)絡(luò)。在這個(gè)網(wǎng)絡(luò)中,研究人員采用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)驗(yàn)證了兩個(gè)miRNA-mRNA的相互作用(Y-47靶向FSHB;ssc-miR-133a-3p靶向GNAI3)。 此項(xiàng)研究將有助于更好地理解動(dòng)物產(chǎn)后生長(zhǎng)的潛在分子機(jī)制。
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