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北京綠源伯德生物科技有限公司
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閱讀:327發(fā)布時間:2015-7-31
垂體前葉是調(diào)控動物產(chǎn)后生長zui重要的內(nèi)分泌器官,主要是通過控制生長激素(GH)基因轉(zhuǎn)錄,合成以及分泌。作為動物產(chǎn)后生長研究的理想模型,巴馬小型豬相較于大型豬具有較低的生長性能和較少的個體差異。
在本項研究中,華南農(nóng)業(yè)大學張永亮教授的課題組采用miRNA芯片和mrna-seq對巴馬小型豬和長白豬垂體前葉的miRNA和mRNA表達譜進行了關(guān)聯(lián)分析。共檢出222個miRNAs和12,909個轉(zhuǎn)錄本,這些miRNAs和mRNAs在兩個品種中表現(xiàn)出較高的相關(guān)性(r>0.97)。實驗鑒定到41個差異表達的miRNA和2,254個差異表達的轉(zhuǎn)錄本。通路分析表明,在兩個品種中共有32個通路存在顯著差異。值得注意的是,兩個GH調(diào)節(jié)信號通路——cAMP和三磷酸肌醇(IP3),以及多個GH分泌相關(guān)的轉(zhuǎn)錄本在巴馬小型豬中顯著下調(diào)。進一步地,研究人員使用TargetScan和RNAhybrid預測了差異表達miRNAs(DE miRNAs)和差異表達基因(DE mRNAs)的相互作用。有趣的是,通過分析它們的變化倍數(shù),發(fā)現(xiàn)大多數(shù)DE miRNA–DE mRNA靶基因?qū)?63.68–71.33%)呈現(xiàn)負相關(guān)的表達模式。研究人員提出了一個可能的miRNAs,基因,和GH調(diào)控通路之間的網(wǎng)絡。在這個網(wǎng)絡中,研究人員采用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞C了兩個miRNA-mRNA的相互作用(Y-47靶向FSHB;ssc-miR-133a-3p靶向GNAI3)。 此項研究將有助于更好地理解動物產(chǎn)后生長的潛在分子機制。
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