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小量細(xì)菌克隆的雜交法篩選實(shí)驗(yàn)步驟

閱讀:845發(fā)布時(shí)間:2016-4-22

小量細(xì)菌克隆的雜交法篩選實(shí)驗(yàn)步驟,一、材料

1. 培養(yǎng)基

含有適當(dāng)抗菌素的 LB 或 SOB 瓊脂板。

含有*的 LB 或 SOB 瓊脂板。

2. 設(shè)備

(1) 硝酸纖維素膜(Millipore HAWP,或類(lèi)似產(chǎn)品)或尼龍膜。

濾膜不必是無(wú)去污劑污染或無(wú)菌。

(2) 注射器(3cc ),針頭(18 號(hào))和防水黑色墨汁(India 墨汁)

以上材料用于標(biāo)記濾膜在主瓊脂板上的方向。

(3) 木制牙簽或接種環(huán)。

3. 載體和菌種

E.coli,用于重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化。

E.coli,用于非重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化(如 pUC,作為陰性對(duì)照)。

小量細(xì)菌克隆的雜交法篩選實(shí)驗(yàn)步驟,二、方法

1. 將硝酸纖維膜或尼龍膜鋪于含有選擇性抗菌素的瓊脂板(實(shí)驗(yàn)平板)上。

由于手指上的油會(huì)影響濾膜浸濕并妨礙 DNA 轉(zhuǎn)移,操作濾膜時(shí)應(yīng)帶上手套。

2. 在一張繪圖紙上畫(huà)出數(shù)字標(biāo)記的方格(方格大小 1 cm2 ),在每一塊瓊脂主板的底部標(biāo)記數(shù)字,并把瓊脂板放在方格紙上,在瓊脂板邊緣的 6 點(diǎn)鐘位置上作好標(biāo)記。

這樣標(biāo)記將使主板于方格的方向一致。

3. 用無(wú)菌牙簽或接種環(huán)將菌落逐一地轉(zhuǎn)移至實(shí)驗(yàn)板的濾膜上和含有選擇性抗菌素的主板上(沒(méi)有濾膜)。按照板下方的方格將菌落劃成 2~3 mm 的短線(xiàn)或點(diǎn),每一菌落在兩塊板中的位置相同。

一塊 90 mm 板可劃 100 個(gè)克隆。

4. zui后在濾膜和主瓊脂板上各劃一個(gè)含非重組質(zhì)粒(如 pUC) 的克隆。

陰性對(duì)照對(duì)于用放射性探針區(qū)別空質(zhì)粒和重組質(zhì)粒是必要。從重組質(zhì)粒的限制酶切產(chǎn)物和瓊脂糖電泳中提取的 DNA 片段常被質(zhì)粒 DNA 序列污染,當(dāng)污染的 DNA 片段用作雜交探針進(jìn)行轉(zhuǎn)化克隆的 Grunstein-Hogness 篩選時(shí),就會(huì)造成麻煩。

5. 倒置瓊脂板置于 37℃ 培養(yǎng)直至菌線(xiàn)的寬度校至 0.5~1.0 mm ( 通常需 6~16 h)。

這一階段,如細(xì)菌生長(zhǎng)仍然很快,濾膜應(yīng)轉(zhuǎn)至含有*的瓊脂板,再于 37℃ 進(jìn)一步培養(yǎng) 12 h(Hanahan and Meselson 1980,1983)。這個(gè)擴(kuò)增的過(guò)程只有在重組質(zhì)粒的拷貝數(shù)預(yù)計(jì)很低的情況下(如插入的是較大的外源 DNA 片段 ),或當(dāng)簡(jiǎn)并度較高的寡核苷酸用作探針時(shí),是必要的??寺〉?DNA 片段通常很容易通過(guò)雜交被檢出,不需要預(yù)*行重組質(zhì)粒的擴(kuò)增。擴(kuò)增只對(duì)那些以松散方式復(fù)制的質(zhì)粒是有效的。

6. 在三個(gè)或更多不對(duì)稱(chēng)的位置上標(biāo)記濾膜,用連在裝有防水墨汁注射器上的 18 號(hào)針頭將濾膜刺穿直至實(shí)驗(yàn)板的瓊脂中。在主板相近的位置上也作同樣標(biāo)記。

實(shí)踐中,用空的 18 號(hào)針頭在濾膜和下層瓊脂間穿孔而避免使用墨水(墨水會(huì)弄得很臟),是可能的,雜交 后,通過(guò)來(lái)自光盒的背光可以對(duì)濾旗上的孔與瓊脂上的痕跡進(jìn)行校對(duì)。

很多研究者更喜歡用剪刀在濾膜四周不同位置上剪出缺口的方法來(lái)確定方向。將剪出缺口并作好標(biāo)記的濾膜置于瓊脂表面,而后在培養(yǎng)板背面標(biāo)記出濾膜鋸齒狀邊緣的位置。這樣通過(guò)鋸齒的形狀和位置就可確定在培養(yǎng)板上的方向。

7. 用 Parafilm 膜將主板封好,顛倒后于 4℃ 保存,直至得出雜交實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。

8. 裂解附著于濾膜上細(xì)菌,將釋放出的 DNA 結(jié)合到硝酸纖維素膜或尼龍膜上。進(jìn)行雜交。小量細(xì)菌克隆的雜交法篩選實(shí)驗(yàn)步驟,


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