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質(zhì)粒DNA的大量制備
在豐富培養(yǎng)基中擴增質(zhì)粒
細菌的收獲和裂解
收獲
堿裂解法
(一)在豐富培養(yǎng)基中擴增質(zhì)粒 許多年來,一直認為在*存在下擴增質(zhì)粒只對生長在基本培養(yǎng)基上的細菌有效,然而在帶有pMBl或ColEl復(fù)制子的高拷貝數(shù)質(zhì)粒的大腸桿菌菌株中,采用以下步驟可提高產(chǎn)量至每500ml培養(yǎng)物2-5mg質(zhì)粒DNA,而且重復(fù)性也很好。ELISA試劑盒
1)將30ml含有目的質(zhì)粒的細菌培養(yǎng)物培養(yǎng)到對數(shù)晚期(DNA 600約0.6)。培養(yǎng)基中應(yīng)含有相應(yīng)抗生素,用單菌落或從單菌落中生長起來的小量液體閉關(guān)物進行接種。
2)將含相應(yīng)抗生素的 500ml LB或Terrific肉湯培養(yǎng)基(預(yù)加溫至37℃)施放入25ml對數(shù)晚期的培養(yǎng)物,于37℃劇烈振搖培養(yǎng)25小時(搖床轉(zhuǎn)速300轉(zhuǎn)/分),所得培養(yǎng)物的OD 600值約為0.4。
3)可做可不做:加2.5ml*溶液(34mg/ml溶于乙醇),使終濃度為170μg/ml。像 pBR322一類在宿主菌內(nèi)只以中等拷貝婁竿行復(fù)的質(zhì)粒,有必要通過擴增。這些質(zhì)粒只要從生長達到餉新一代的質(zhì)粒(如pUC質(zhì)粒)可復(fù)制達到很高的拷貝數(shù),因此無需擴增。這些質(zhì)粒只要從生長達到飽和的細菌培養(yǎng)物即可大量提純。但用*進行處理,具有抑制細菌復(fù)制的優(yōu)點,可減少細菌裂解物的體積和粘稠度,極大地簡化質(zhì)粒純化的過程。所以一般說來,盡管要在生長中的細菌培養(yǎng)物里加入*略顯不便,但用*處理還是利大于弊。 4)于37℃劇烈振搖(300轉(zhuǎn)/分),繼續(xù)培養(yǎng)12-16小時。
(二)細菌的收獲和裂解
1.收獲
1)用合適轉(zhuǎn)頭于4℃以4000轉(zhuǎn)/分離心15分鐘,棄上清,敞開離心管口并倒置離心管使上清全部流盡。
2)將細菌沉淀重懸于100ml用冰預(yù)冷的STE中。
STE
0.1mol/L NaCl
10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)
1mmol/L EDTA(pH8.0)
2)按步驟1)所述方法離心,以收集細菌細胞。ELISA試劑盒
2,堿裂解法
1)將冼過的500ml 培養(yǎng)物的細菌沉淀物[ 來自收獲細菌的步驟3] 重懸于10ml(18ml)溶液I中。
溶液I
50mmol/L 葡萄糖
25mmol/L Tris.Cl(pH8.0)
10mmol/L EDTA(pH8.0)
溶液I可成批配制,在 10 lbf/in2(6.895x104Pa)高壓下蒸氣滅菌15分鐘,貯存于4℃。
2)加1ml(2ml)新配制的*溶液 [10mg/ml,溶于10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)]。當(dāng)溶液的pH值低于8.0時,*不能有效工作。
3)加 20ml(40ml)新配制的溶液Ⅱ。
溶液Ⅱ
0.2mol/L NaOH(臨用前用10mol/L貯存液現(xiàn)用現(xiàn)稀釋)
1%SDS
蓋緊瓶蓋,緩緩顛倒離心瓶數(shù)次,以充分混勻內(nèi)容物。于室溫放置5-10分鐘。
4)加15nl(20ml)用冰預(yù)冷的溶液Ⅲ。
溶液Ⅲ
5mol/L乙酸鉀
60ml 冰乙酸
11.5ml 水
28.5ml 所配成的溶液對鉀是3mol/L,對乙酸根是5mol/L。
封住瓶口,搖動離心瓶數(shù)次以混勻內(nèi)容物,此時應(yīng)不再出現(xiàn)分明的兩個液相。置冰上放 10分鐘,應(yīng)形成一白色絮狀沉淀。于0℃放置后所形成的沉淀應(yīng)包括染體DNA、 高分子量RNA和鉀-SDS-蛋白質(zhì)-膜復(fù)合物。
5)用合適轉(zhuǎn)頭于4℃以4000轉(zhuǎn)/分離心15分鐘,不開剎車而使轉(zhuǎn)頭自然停轉(zhuǎn)。如果細菌碎片貼壁不緊,可以5000轉(zhuǎn)/分再度離心20分鐘, 然后盡可能將上清全部轉(zhuǎn)到另一瓶中,棄去殘留在離心管內(nèi)的粘稠狀液體。未能形成致密沉淀塊的原因通常是由于溶液Ⅲ與細菌裂解物混合不充分[步驟4)]。
6)上清過濾至一250ml離心瓶中,加0.6體積的異丙醇,充分混勻,于室溫放置10分鐘。
7)用合適轉(zhuǎn)頭于室溫以500轉(zhuǎn)/分離心15分鐘,回收核酸。如于4℃離心,鹽也會了生沉淀。
8)小心倒掉上清,敞開瓶口倒置離心瓶使殘余上清液流盡,于室溫用70%乙醇洗滌沉積管壁。倒出乙醇,用與真空裝置相聯(lián)的巴期德吸出附于瓶壁的所有液滴,于室溫將瓶倒置放在紙巾上,使zui后殘余的痕量乙醇揮殆盡。
9)用3ml TE(pH8.0)溶解核酸沉淀。ELISA試劑盒
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