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暗科技:這家公司會刷新你對基因檢測的認(rèn)識

時(shí)間:2016/7/19閱讀:1223
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嘗試過基因檢測的健康人一定遇到過這樣的情況。

檢測報(bào)告里寫到:“正常人群患XX癌癥的概率是7%,你體內(nèi)有XX突變,患癌癥的概率是14%,同時(shí)有12%可能禿頭。”

你心里一定有個(gè)疑問“我到底有沒有患癌癥?”

當(dāng)我們談?wù)摶驒z測的時(shí)候,談?wù)摰钠鋵?shí)是DNA檢測。我們忽略了RNA,它是基因檢測中缺失的重要一環(huán)。但是,這一環(huán)也許會告訴你有沒有患病。

今天給大家介紹一家也做基因檢測的公司,它就是位于美國加州的Cofactor Genomics。之所以要介紹這家公司,是因?yàn)樗鼡炱鹆嘶驒z測中缺失的一個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié),它這一舉動有可能開了基因檢測領(lǐng)域的另一個(gè)先河–circRNA診斷。至于circRNA診斷是個(gè)什么東西,先按下不表,稍后你就會知道。

我們注意到這家公司的原因是,今年7月21日Cofactor Genomics對外宣布它獲得了美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)150萬美元的資助。當(dāng)然150萬美元對于一家生物技術(shù)公司來說,算不得什么。但是,我認(rèn)為NIH資助的象征性意義,要遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于這點(diǎn)金錢帶來的好處。NIH資助的Cofactor Genomics的原因也很簡單,越來越多的研究表明circRNA與包括冠狀動脈疾病、帕金森病、精神疾病、癌癥在內(nèi)的疾病,有重大的關(guān)系。目前已經(jīng)有研究表明circRNA可以作為生物標(biāo)志物診斷某些疾病。

好了,先一起來看看circRNA診斷是什么,以及它的重要性。

其實(shí)介紹這家公司,讓我挺頭疼的。在咱們國家,大家都還沒有明白DNA診斷,現(xiàn)在又冒出來一個(gè)circRNA診斷,真不知從何說起。

現(xiàn)在大家基本上都知道我們的生老病死是跟基因有關(guān)的。但是基因這個(gè)東西就是信息啊,并不直接參與生老病死。這個(gè)信息是沿著DNA→RNA→蛋白質(zhì),一級級傳遞,zui終由蛋白質(zhì)實(shí)現(xiàn)我們的生命功能的(比如,你的指甲,你的肌肉,都主要是蛋白質(zhì)構(gòu)成)。你要是還不理解,我就只能給你打比方了。

如果將一個(gè)公司的結(jié)構(gòu)簡化成三級,*的決策層、中間的管理層、下面的執(zhí)行層。那么,公司的信息(或者決策)就會沿著這個(gè)層級流動,zui終完成任務(wù)?,F(xiàn)在我們通過DNA檢測診斷疾病,就類似于通過分析公司上層的決策文件,了解任務(wù)能不能完成。如果上層決策文件出了問題,任務(wù)自然完不成。這就是DNA檢測可以診斷疾病的原因。大腦靈活的朋友肯定立馬問,上層的決策文件沒有問題,任務(wù)就一定會完成嗎?當(dāng)然不是,你還得看中間管理層不是?如果管理層這里出了問題,任務(wù)一樣完不成。這就是DNA檢測的缺陷,這正是RNA檢測的優(yōu)勢。

我們知道在一個(gè)公司決策層可以只有一個(gè)人,但是管理層卻是一大幫人。我們的細(xì)胞里面也是這樣,DNA就是DNA,但是RNA卻有一大幫。我們暫且不扯那么多,一是因?yàn)楸疚牟簧婕?,而是怕把大家繞暈了。本文只講mRNA(信使RNA,messenger RNA)、circRNA(環(huán)狀RNA,circular RNA)和miRNA(小RNA,micro RNA)。

如果我們把mRNA比作是直接對蛋白質(zhì)下達(dá)命令的管理層,那么miRNA和circRNA就是輔助下令的謀士。只不過miRNA是保守的文官,總是說“主公(mRNA),此事萬萬做不得呀!”;circRNA則是激進(jìn)的武官,總會說“主公(mRNA),我等誓死擁護(hù)你的決定!”(但是,這里要申明一下,并不是所有的“主公”都有“謀士”。至于“主公”的“謀士”是怎么來的,為什么來,這個(gè)現(xiàn)在恐怕只有造物主知道。)

circRNA不在的時(shí)候,miRNA黏到對應(yīng)的mRNA阻止蛋白質(zhì)的生成

circRNA出現(xiàn),拖走miRNA,mRNA合成蛋白質(zhì)

mRNA沒有人類那樣的思考能力,它不知道到底該不該像女媧那樣,制造沒腦的苦力蛋白質(zhì)去干活。但是,如果保守的文官miRNA一直抱著他的大腿,那么mRNA就沒工夫制造蛋白質(zhì),事情就做不了(專業(yè)術(shù)語叫“基因的表達(dá)被抑制了”);要是激進(jìn)的武官circRNA過來把黏在mRNA身上的miRNA全部拖走,mRNA就會立馬制造蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)就不分對錯(cuò)的開始干活(專業(yè)術(shù)語叫“基因的抑制被解除了”)。你現(xiàn)在明白了嗎?

下面再舉幾個(gè)具體的例子,讓我們看看circRNA和miRNA跟癌癥的關(guān)系。

BCL2基因是一個(gè)癌基因,它與白血病、淋巴瘤和前列腺癌的發(fā)生密切相關(guān)。在正常的情況下,BCL2基因的mRNA表達(dá)被相應(yīng)miRNA黏住了,所以基因不表達(dá),癌癥不發(fā)生;但是如果對應(yīng)的circRNA出現(xiàn)了,那么miRNA就被活活拖走了,BCL2基因的mRNA就開始女媧造人般的制造蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)促進(jìn)細(xì)胞的癌變,悲劇就發(fā)生了。

再來看看大名鼎鼎的抑癌基因P53,很多癌癥的發(fā)生都與它的苦力蛋白質(zhì)無法合成有關(guān)(當(dāng)然,P53蛋白功能缺失的原因有很多,我們不一一介紹)?,F(xiàn)在有研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了拖住P53基因mRNA的miRNA,這個(gè)時(shí)候如果對應(yīng)的circRNA出現(xiàn),P53基因mRNA就可以順利制造蛋白質(zhì)了,細(xì)胞癌變就會被阻止。

由上面兩個(gè)例子不難看出,circRNA并無好壞之分,zui終circRNA解除miRNA對基因表達(dá)的抑制,帶來的后果,是跟對應(yīng)基因的功能直接相關(guān)的。

現(xiàn)在你大概能夠明白,circRNA檢測可以診斷疾病的原因了。如果你懂了,卻覺得打的比方、舉得例子不夠嚴(yán)謹(jǐn),請你不要挑刺,我也不接受挑刺。你懂得就好。

但是,你心里也許還有另外一個(gè)疑問,“既然circRNA如此重要,你們早干啥去了,怎么到現(xiàn)在才開始檢測這個(gè)?”

這個(gè)說來也挺委屈的,真不怪科學(xué)家們??!實(shí)際上早在1991年就在人體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了circRNA,但是當(dāng)時(shí)認(rèn)為你這個(gè)家伙太了。一直以來都被大家所忽視,直到2012年斯坦福大學(xué)的Julia Salzman發(fā)現(xiàn)circRNA在人體大量存在,這一改變教科書級的事實(shí)才大白于天下。緊接著2013年兩篇重量級研究circRNA功能的文章發(fā)表在《Nature》上。研究circRNA的熱潮開啟了,越來越多的研究證明circRNA和很多疾病都有關(guān)系。

創(chuàng)立于2008年的Cofactor Genomics公司,是由參與人類基因組計(jì)劃的科學(xué)家創(chuàng)辦的,他們主要從事于RNA的測序,多年來已經(jīng)積累了很多的測序經(jīng)驗(yàn)。然后在目前研究circRNA的大背景下,Cofactor Genomics于今年轉(zhuǎn)型,希望利用circRNA診斷疾病。當(dāng)然,目前Cofactor Genomics的產(chǎn)品還處于研發(fā)階段,不過*階段的研發(fā)工作已經(jīng)順利完成,NIH資助的是他們第二階段的研發(fā)工作。預(yù)計(jì)明年會有產(chǎn)品上市。

當(dāng)然,你不要以為我是在貶低DNA檢測,實(shí)際上DNA檢測和RNA檢測一樣重要,circRNA診斷是DNA診斷的一個(gè)重要的補(bǔ)充。

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