液相色譜儀用的基質(zhì)主要有如下幾種：
1 硅膠
硅膠是HPLC填料中zui普遍的基質(zhì)。除具有較高強度外，還提供一個表面，可以通過成熟的的硅烷化技術(shù)鍵合上各種配基，制成反相、離子交換、疏水作用、親水作用或分子排阻色譜用填料。硅膠基質(zhì)填料適用于廣泛的極性和非極性溶劑。缺點是在堿性水溶性流動相中不穩(wěn)定。
2 氧化鋁
具有與硅膠相同的良好物理性質(zhì)，也能耐較大的pH的范圍。它也是剛性的，不會再溶劑中收縮或膨脹。但與硅膠不同的是，氧化鋁鍵合相在水性流動相中不穩(wěn)定，不過現(xiàn)在已經(jīng)出現(xiàn)了在水相中穩(wěn)定的氧化鋁鍵合相，并顯示出的ph穩(wěn)定性。
3 聚合物
以高交聯(lián)度的苯乙烯—二乙烯本或聚甲基丙烯酸酯為基質(zhì)的填料是用于普通壓力下的HPLC，他們的壓力限度比無機填料低。苯乙烯—二乙烯苯基質(zhì)疏水性強。使用任何流動相，在整個pH范圍內(nèi)穩(wěn)定，可用NaOH或強堿來清洗色譜柱。甲基丙烯酸酯基質(zhì)本質(zhì)上比苯乙烯—二乙烯本疏水性更強，但它可以通過適當(dāng)?shù)墓δ芑揎椬兂汕厮缘摹＿@種基質(zhì)不如苯乙烯—二乙烯那樣耐酸堿，但也可以承受在pH=13下反復(fù)沖洗。
所有聚合物基質(zhì)在流動相發(fā)生變化時都會出現(xiàn)膨脹或收縮。用于HPLC的高交聯(lián)度聚合物填料，其膨脹和收縮要有限制。溶劑或小分子溶劑滲入聚合物基質(zhì)中，因為小分子在聚合物基質(zhì)中的傳質(zhì)比在陶瓷性基質(zhì)中慢，所以造成小分子在這種基質(zhì)中柱效低。對于大分子像蛋白質(zhì)或合成的高聚物，聚合物基質(zhì)的效能比得上掏出小基質(zhì)，因此，聚合物基質(zhì)廣泛用于分離大分子物質(zhì)。
