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上海酶聯(lián)生物研究所
上海酶聯(lián)生物研究所
閱讀：655發(fā)布時間：2011-1-13
通過基因分型方法，我們具有了分辨出結(jié)核分支桿菌隔離群分子“ 指紋”（基因型）的能力，這在很大程度上革新了我們對結(jié)核傳播的理解。
多方面的應(yīng)用
在臨床上，基因分型可以幫助我們進行一些的鑒別。①排除實驗室交叉感染。據(jù)調(diào)查，由于交叉感染，大約3％的在實驗室診斷患者其實并沒有結(jié)核。此時實驗室結(jié)果和臨床癥狀并不一致，通過對隔離群和其他結(jié)核分支桿菌進行基因分型處理，可以讓真相大白，繼而終止交叉感染引起的錯誤的抗癆治療。②區(qū)分復(fù)發(fā)和再感染。確定再發(fā)結(jié)核是復(fù)發(fā)還是再感染很重要，因為只有前者代表治療失敗。如為復(fù)發(fā)，原隔離群的敏感性可以指導(dǎo)治療，并找到治療失敗的原因。如果證明為再感染，那么應(yīng)該尋找來源。③檢測暴發(fā)。如果流行病學(xué)資料提示發(fā)生一次結(jié)核暴發(fā)，對分離物進行基因分型，結(jié)合流行病學(xué)調(diào)查，可以幫助確定是否真的發(fā)生了暴發(fā)，或者還是巧合出現(xiàn)了大量病例。
在流行病研究方面，流行病學(xué)不相關(guān)的結(jié)核基因型有很大變異性，反之，普通來源感染的患者其分離物基因型是相同的。因此，那些有相同或相近基因型的分離物被定義為群發(fā)的結(jié)核病例，zui近通常傳播。這個概念有兩點要注意。*，基因分型數(shù)據(jù)同流行病學(xué)資料一起解釋。例如，在很多城市，那些相同基因型的患者均為zui近感染，然而，在農(nóng)村地區(qū)，共同的基因型并不反映均為zui近感染。第二，確定群發(fā)病例需要長期檢測人群中很大比例的病例，否則會影響結(jié)論的準確性。
分子流行病學(xué)研究已經(jīng)幫助我們確定了很多容易暴發(fā)結(jié)核的地區(qū)，從而把公共衛(wèi)生干涉的注意力集中于此。例如，在洛杉磯，無家可歸的避難所被確定為結(jié)核傳播的主要地點。
有益的提示
傳統(tǒng)的觀點認為結(jié)核分支桿菌菌株具有同等的毒力。然而，基于人群的基因分型已經(jīng)表明一小部分菌株引起了與之不相稱的大量的病例，揭示有些菌株傳播力高于其他。如CDC1551菌株曾引起一次大暴發(fā)，從這個菌株提取的類脂可以激活單核細胞產(chǎn)生非常高濃度的炎性因子，這可能導(dǎo)致這類患者有異常大尺寸的結(jié)核菌素皮膚試驗反應(yīng)。另一個研究中，感染了一種結(jié)核桿菌的小鼠不能參與一些特定的免疫反應(yīng)，并且比感染另一種菌株的小鼠更快死亡。這些研究揭示各種各樣的結(jié)核桿菌對宿主有不同的作用，具有不同的傳播潛力。
傳播力zui強的結(jié)核分支桿菌菌株是北京家族，它曾導(dǎo)致世界范圍的暴發(fā)，組成這個菌株優(yōu)勢家族分布于亞洲和北美洲的多數(shù)地區(qū)。北京家族包括在美國東北部大量暴發(fā)的W家族菌株，和在美國*南部流行的210菌株。
北京菌株可能廣泛分布，與其他菌株比較，北京菌株更易被霧化，可以更有效地建立傳染，或者更迅速地從感染發(fā)展為疾病。這個假設(shè)有三個發(fā)現(xiàn)支持。*，在越南，北京隔離群在年輕患者比老年患者更常見，提示這些菌株近期流行。第二，一個北京隔離群被引入一個島嶼后，它迅速流行，在三年內(nèi)引起27％的結(jié)核病例。第三，北京家族的成員之一，210菌株，在巨噬細胞內(nèi)比其他菌株生長更快，提示它能更有效地逃避宿主的抵御。
將來的前景
迄今為止，基因分型僅被有限數(shù)量的結(jié)核控制計劃應(yīng)用。阻礙其廣泛應(yīng)用的是基于IS6110的基因分型的復(fù)雜性，獲得數(shù)據(jù)所需的長期性和高額的費用。如果這些障礙能得到解決，前瞻性的基因分型研究可以與例行的結(jié)核控制活動結(jié)合起來，從而確定、防范可疑的暴發(fā)。
監(jiān)督基因分型需要來源的保證；實驗室和公共衛(wèi)生工作人員的密切交流；宜操作可重復(fù)的，快速的基因分型方法；能夠使用簡單的方法來比較大量分離物的基因型。較新的MIRU分析是監(jiān)督基因分型zui有希望的候選方法，可以在數(shù)日內(nèi)確定群發(fā)病。
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