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公司動(dòng)態(tài)

揭示DNA密碼中的5-羥甲基胞嘧啶隱秘信息

閱讀：875發(fā)布時(shí)間：2012-5-29

      由于缺少在全基因組范圍內(nèi)，對(duì)5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）進(jìn)行單個(gè)堿基水平分辨率的作圖手段，對(duì)5hmC的研究一直進(jìn)展緩慢。傳統(tǒng)的親和純化手段不能準(zhǔn)確定位5hmC，也不能確定它在每一修飾位點(diǎn)的相對(duì)豐度。Chuan He等人運(yùn)用Tet輔助的重亞硫酸鹽測(cè)序（TAB-Seq）技術(shù)，與傳統(tǒng)的重亞硫酸鹽測(cè)序技術(shù)結(jié)合,在基因組范圍內(nèi)以單個(gè)堿基的分辨率對(duì)5hmC進(jìn)行作圖，并確定5hmC與5mC的相對(duì)豐度。

將這一技術(shù)應(yīng)用于胚胎干細(xì)胞，他們不僅證實(shí)了5hmC在哺乳動(dòng)物基因組中廣泛分布，而且顯示5hmC位點(diǎn)更易于出現(xiàn)在某些特殊序列當(dāng)中，并具有在兩條DNA鏈分布的不對(duì)稱性。他們還發(fā)現(xiàn)鄰近轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的DNA位點(diǎn)存在高水平的5hmC和低水平的5mC。此外，5hmC分布水平在不同功能序列元件之間差異也很大。這提示5hmC的修飾和保持在這些元件之間的機(jī)制是不同的。


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