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施一公Cell子刊文章:與經(jīng)典不同的新機(jī)制

時(shí)間:2013-4-7閱讀:271
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生物通報(bào)道:來自清華大學(xué)生科院,生物膜與膜生物工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的研究人員報(bào)道了硝酸鹽/亞硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白:NarU的晶體結(jié)構(gòu)(分辨率為3.1Å),并分析了其結(jié)構(gòu)和生化特征,指出這種轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白具有一種與經(jīng)典搖桿開關(guān)模型不同的轉(zhuǎn)運(yùn)新機(jī)制。生物通 
這一研究成果公布在Cell出版社全新開放獲取期刊:Cell Reports雜志上,這是Cell出版社在Cell Stem Cell和Cell Host & Microbe兩份期刊后的又一重要新成員。Cell Reports致力于報(bào)道整個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域的高質(zhì)量研究成果,主要集中于短小,單個(gè)觀點(diǎn)的文章,也接受標(biāo)準(zhǔn)長度的論文,因此這一期刊命名為Reports。
文章的通訊作者是清華大學(xué)生命*院長施一公教授,其研究組主要研究方向?yàn)檫\(yùn)用結(jié)構(gòu)生物學(xué)和生物化學(xué)的手段研究腫瘤發(fā)生和細(xì)胞調(diào)亡的分子機(jī)制,與重大疾病相關(guān)膜蛋白的結(jié)構(gòu)與功能的研究,以及細(xì)胞內(nèi)生物大分子機(jī)器的結(jié)構(gòu)與功能研究等。生物通 磷脂雙層膜為細(xì)胞或細(xì)胞器提供了一道疏水屏障,其中的膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白承擔(dān)著營養(yǎng)物質(zhì)吸收、代謝產(chǎn)物分泌、細(xì)胞與外界的物質(zhì)信息交換以及產(chǎn)能耗能等一系列重要的生理活動(dòng)。根據(jù)轉(zhuǎn)運(yùn)能量的來源可以將轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白分為初級主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(primary active transporters)和次級轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(secondary transporters)。 生物通 其中次級轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白利用由于物質(zhì)在膜內(nèi)外濃度不同造成的電化學(xué)滲透勢能來轉(zhuǎn)運(yùn)底物,典型代表是主要協(xié)助轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白超家族(major facilitator superfamily,MFS)。MFS超家族zui初發(fā)現(xiàn)時(shí)被認(rèn)為只在糖的吸收過程中起作用,隨后的研究發(fā)現(xiàn)藥物的外排系統(tǒng)、有機(jī)磷∶磷酸交換系統(tǒng)等中的蛋白也都屬于這一超家族。
硝酸鹽/亞硝酸鹽的轉(zhuǎn)運(yùn)元件NarK和NarU也屬于這一超家族的硝酸鹽/亞硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)家族(nitrate/nitrite porter family,NNP),在維持細(xì)菌體內(nèi)的氮平衡中扮演了重要的角色,但是其結(jié)構(gòu)和功能機(jī)制,至今科學(xué)家們?nèi)匀徊磺宄?。生物?在這篇文章中,研究人員報(bào)道了NarU的晶體結(jié)構(gòu)(分辨率為3.1Å),并由此分析了其整體生化特性。研究人員發(fā)現(xiàn)非對稱單元中NarUto的兩個(gè)分子具有兩種不同的構(gòu)象狀態(tài):關(guān)閉和部分向內(nèi)打開。其中底物硝酸分子似乎是通過4個(gè)高度保守的帶點(diǎn),或稱極性氨基酸協(xié)調(diào)進(jìn)行作用。
通過結(jié)構(gòu)和生化試驗(yàn)分析,研究人員還找到了參與底物門控和轉(zhuǎn)運(yùn)的關(guān)鍵氨基酸。這些觀察到的NarU構(gòu)象差異,以及NNP家族的*序列特征,都指出這一家族具有一種與經(jīng)典搖桿開關(guān)模型(rocker-switch model,生物通譯)似乎不同的轉(zhuǎn)運(yùn)新機(jī)制。來源:生物通

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