上海滬宇科學(xué)家們一直致力于在基因組中尋找與癌癥有關(guān)的遺傳學(xué)改變。在此基礎(chǔ)上，人們對癌癥的理解以及癌癥治療都取得了巨大的進(jìn)展。

這類研究大多關(guān)注基因組的編碼區(qū)域，但這一區(qū)域只占到人類DNA的2%，應(yīng)該還有大量癌癥相關(guān)突變發(fā)生在非編碼DNA上。非編碼DNA曾被稱為“垃圾DNA”，雖然人們早已知道它們其實并不是垃圾（許多轉(zhuǎn)錄為RNA），但解析這些序列的功能并不容易。

研究人員在卵巢癌、乳腺癌等12種癌癥中，建立了將近14,000個長非編碼RNA（lncRNA）的DNA拷貝數(shù)圖譜。卵巢癌和乳腺癌是兩個主要的BRCA相關(guān)癌癥。隨后，他們以臨床、遺傳學(xué)和基因表達(dá)數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)進(jìn)行過濾，剔除了與癌癥無關(guān)的拷貝數(shù)改變，系統(tǒng)地研究了剩下的37個 lncRNA。

研究顯示，1號染色體上的FAL1（focally amplified lncRNA）就是一個RNA癌基因。迄今為止，只有少數(shù)lncRNA與癌癥關(guān)聯(lián)起來。研究人員給免疫功能低下的小鼠引入人類卵巢腫瘤，然后注入siRNA對FAL1進(jìn)行RNA干擾，這一措施成功使腫瘤出現(xiàn)了萎縮。

個性化診斷

FAL1在卵巢癌和乳腺癌中存在過表達(dá)，通過RNAi阻斷該基因的活性，能減少癌細(xì)胞的生長。另一方面，這個基因的過表達(dá)會促進(jìn)細(xì)胞的生長。研究人員在人卵巢癌樣本中進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)FAL1的高表達(dá)與預(yù)后差有關(guān)。

為了鑒定FAL1的功能，研究人員找到了與FAL1 RNA有關(guān)的蛋白BMI1。BMI1是基因調(diào)控復(fù)合體PRC1中的一員，能下調(diào)數(shù)百個基因的表達(dá)，其中就包括編碼腫瘤抑制蛋白p21的基因。研究顯示，FAL1缺失會使BMI1蛋白變得不穩(wěn)定。

研究指出，卵巢癌中的FAL1擴(kuò)增使FAL1 RNA過量，增強(qiáng)了BMI1蛋白的穩(wěn)定性，下調(diào)了p21，并zui終導(dǎo)致細(xì)胞生長脫離控制。FAL1的表達(dá)可以作為生物學(xué)指標(biāo)，幫助人們預(yù)測BRCA相關(guān)癌癥的預(yù)后情況。另外，人們也可以開發(fā)小分子藥物，特異性靶標(biāo)FAL1 RNA或者阻斷FAL1-BMI1相互作用，對相關(guān)癌癥進(jìn)行治療。