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上海滬宇生物科技有限公司

研究人員操縱Set2途徑揭示基因忠實(shí)的復(fù)制機(jī)制

時間:2012-8-29閱讀:354
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    基因表達(dá)的*步就是利用RNA聚合酶II將一段DNA地拷貝到鏡像RNA之中??茖W(xué)家們認(rèn)識到pol II并不沿著DNA高速軌道輕柔地滑動來將它轉(zhuǎn)錄為RNA,相反它在緊密地纏繞著被稱作組蛋白的屏障蛋白的DNA上遭遇著重重障礙。在之前的研究中,美國斯托瓦斯醫(yī)學(xué)研究所研究員Jerry Workman博士證實(shí)一旦一輪轉(zhuǎn)錄完成之后,為了阻止?jié)撛谟泻Φ腞NA的片段表達(dá),在生化上與pol II結(jié)合的蛋白Set2如何恢復(fù)抑制性的組蛋白環(huán)境。他的研究團(tuán)隊(duì)利用Set2發(fā)生突變的酵母揭示出細(xì)胞利用一個令人吃驚的機(jī)制來維持基因表達(dá)繼續(xù)進(jìn)行下去,不論是在合適環(huán)境之下,還是在不合適的環(huán)境之下,如像癌細(xì)胞中那樣。

 

    兩類染色質(zhì)重塑因子相互競爭來激活或抑制基因表達(dá)。“激活者”通過利用乙酰基修飾組蛋白從而讓組蛋白放松對DNA的控制,這就讓組蛋白脫離DNA從而允許pol II通過DNA高速軌道上的重重障礙。另一類發(fā)揮相反作用的染色質(zhì)重塑因子,包括Set2,通過植入它們自己的被稱作甲基的生化標(biāo)記,接著吸引一種酶來移除乙?;鶑亩謴?fù)染色質(zhì)到一種不可訪問的狀態(tài),zui終終止基因表達(dá)。這種抑制確保錯誤的轉(zhuǎn)錄起始并不在一個基因的隱蔽位點(diǎn)上發(fā)生。

 

    在此之前,很多人猜測盡管染色質(zhì)重塑因子對組蛋白進(jìn)行乙?;腿ヒ阴;?,但是組蛋白仍然與一條DNA鏈保持接觸。論文*作者Swami Venkatesh博士認(rèn)為某類組蛋白交換在轉(zhuǎn)錄期間發(fā)生,但是人們并不確認(rèn)在整個基因上,這種交換是否會發(fā)生。為了研究潛在的組蛋白交換,研究人員對釀酒酵母進(jìn)行改造以便追蹤標(biāo)記的組蛋白進(jìn)出染色質(zhì),這樣就可以評估組蛋白的化學(xué)修飾。利用這種系統(tǒng),他們比較了正常酵母和Set2發(fā)生突變的酵母中全部6000個基因的全部乙?;图谆V。

 

    他們首先在正常細(xì)胞中,Set2植入的抑制性甲基化標(biāo)記位于正在表達(dá)中的基因片段的兩側(cè),而且正如期待中的那樣,在Set2發(fā)生突變的酵母中,這種標(biāo)記是缺失的。在這些酵母突變體中,大部分基因的乙?;瘶?biāo)記相反會增加,這也可以從Set2招募去乙?;傅哪芰G失來加以解釋。進(jìn)一步的分析揭示這些乙酰(雙乙酰化的組蛋白中的很多蛋白事實(shí)上并不嵌入在染色質(zhì)之中,相反它們是從外面“進(jìn)口”而來的,或者說它們事先已發(fā)生乙?;_@比較重要,這是因?yàn)榧?xì)胞不用招募一種重構(gòu)酶來對組蛋白再次乙?;?。這些研究還揭示Set2在控制基因表達(dá)中發(fā)揮著比期待中更加復(fù)雜的作用。Workman解釋道,“Set2植入在組蛋白上的甲基標(biāo)記發(fā)揮著兩種功能。它不僅招募去乙?;竵硪瞥M蛋白上的乙酰標(biāo)記,而且這些新發(fā)現(xiàn)提示著它還阻止事先乙?;慕M蛋白整入到基因之中。”

 

    研究人員利用芯片分析還將這些化學(xué)修飾與異常的基因表達(dá)相關(guān)聯(lián)在一起:不同于正常的酵母,Set2發(fā)生突變的酵母產(chǎn)生眾多截斷的隱蔽RNA轉(zhuǎn)錄本。在注意到這些截斷的RNA鏈之后,Workman同意道,它們可能干擾正常的RNA表達(dá)為蛋白。人也有Set2蛋白的對等物,即SETD2,據(jù)報道,它們作為腫瘤抑制物而發(fā)揮作用,而且在包括乳腺癌和腎癌在內(nèi)的幾種類型的癌癥中,它的活性丟失了。鑒于組蛋白交換實(shí)際上在很大程度上發(fā)生,所以這也有助于人們找到抗癌療法。

 

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