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上海邦景實業(yè)有限公司
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?PCR反應體系解析
2023-5-4 閱讀(198)
PCR反應體系解析如下：
1、引物
引物與模板配對的長度應至少為17個核苷酸，最高不宜超過30個核苷酸，最佳長度為20-24個核苷酸，如需插入酶切位點，應在酶切位點5'端多加幾個堿基，有利于酶切。引物的（G+C）%含量組成應均勻，盡量避免含有相同的堿基多聚體；兩個引物中（G+C）%含量應盡量相似；引物內部應避免形成明顯的二級結構，如發(fā)夾結構；兩個引物之間不應發(fā)生互補；特別是在引物3'端最好有富有GC，這樣退火后有利于3'端的延伸。人工合成的引物需經過色譜層析或PAGE純化，以除去未能合成至全長的短鏈等雜質。引物的終濃度一般為0.1-1μM左右，濃度太高會導致非特異性擴增，太低則擴增產物太少。
2、模板
模板可以是單鏈DNA，也可以是雙鏈DNA，質粒DNA的擴增效率略低于線狀DNA。模板量一般不需太多，不超過1μg為宜，因為模板量過多可能導致非特異性擴增增加，但是要考慮模板中靶序列的含量。例如：使用基因組為模板擴增單拷貝或低拷貝靶序列，就需要適當加大模板用量。
3、緩沖液buffer
緩沖液的PH值，鹽離子濃度、助溶劑成分等都會對PCR反應產生影響。Taq酶通用緩沖液PH值為8.4。Mg2+濃度為1.5mM，可以適用于大多數PCR反應，但它并非對任何模板和引物的組合都是最佳的。
4、DNA聚合酶
50μl反應體系可用0.5-5U酶，酶量的選擇與模板DNA的量、擴增片段大小等有關，酶量過多易發(fā)生非特異性反應，而且可能增加突變的機率，尤其在進行高保真擴增時，應盡量減少酶量，但酶量過少時反應性能會下降。
