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基因重組—層析法

2019-9-11  閱讀(757)

實驗方法原理 
攜帶有目標(biāo)蛋白基因的質(zhì)粒在大腸桿菌BL21中,在 37℃,IPTG誘導(dǎo)下,超量表達(dá)攜帶有6個連續(xù)組氨酸殘基的重組氯霉素?;D(zhuǎn)移酶蛋白,該蛋白可用一種通過共價偶連的次氨基三乙酸(NTA)使鎳離子(Ni2+)固相化的層析介質(zhì)加以提純,實為金屬熬合親和層析(MCAC)。蛋白質(zhì)的純化程度可通過聚丙烯酰胺凝膠電泳進(jìn)行分析。

實驗材料 大腸桿菌BL21
試劑、試劑盒 LB液體培養(yǎng)基氨芐青霉素Washing BufferElution BufferIPTG蒸餾水胰蛋白胨酵母粉氯化鈉
儀器、耗材 搖床離心機層析柱離心管移液槍槍頭盒燒杯玻璃棒
實驗步驟 
一、試劑準(zhǔn)備
 

1.  LB液體培養(yǎng)基:Trytone 10 g, yeast extract 5 g,NaCl 10 g,用蒸餾水配至1000 mL。
 

2.  氨芐青霉素:100 mg/mL。
 

3.  上樣緩沖液:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8M Urea,10 mM  2-ME,pH8.0。
 

4.  Washing Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8 M Urea,pH6.3。
 

5.   Elution Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mMTris,8M Urea, 500 mM Imidazole, pH8.0。
 

6.   IPTG:100mM IPTG(異丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中,0.22 um濾膜抽濾,-20℃保存。

 

二、獲得目的基因
 
1.  通過PCR方法:以含目的基因的克隆質(zhì)粒為模板,按基因序列設(shè)計一對引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點),PCR循環(huán)獲得所需基因片段。
 
2.  通過RT-PCR方法:用TRIzol法從細(xì)胞或組織中提取總RNA,以mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA鏈,以逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為模板進(jìn)行PCR循環(huán)獲得產(chǎn)物。
 
三、構(gòu)建重組表達(dá)載體
 
1.  載體酶切:將表達(dá)質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶(同引物的酶切位點)進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。
 
2.  PCR產(chǎn)物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。
 
四、獲得含重組表達(dá)質(zhì)粒的表達(dá)菌種
 
1.  將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,根據(jù)重組載體的標(biāo)志(抗Amp或藍(lán)白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質(zhì)粒,雙酶切初步鑒定。
 
2.  測序驗證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進(jìn)入下步操作。否則應(yīng)篩選更多克隆,重復(fù)亞克隆或亞克隆至不同酶切位點。
 
3.  以此重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌的感受態(tài)細(xì)胞。
 五、氯霉素?;D(zhuǎn)移酶重組蛋白的誘導(dǎo)

1.   接種含有重組氯霉素酰基轉(zhuǎn)移酶蛋白的大腸桿菌BL21菌株于5 mL LB液體培養(yǎng)基中(含100 ug/mL 氨芐青霉素),37℃震蕩培養(yǎng)過夜。
 

2.  按1∶50或1:100的比例稀釋過夜菌,一般轉(zhuǎn)接1 mL過夜培養(yǎng)物于100 mL(含100 ug/mL 氨芐青霉素)LB液體培養(yǎng)基中,37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 = 0.6 - 0.8(0.6,大約需3 h)。取10 ul 樣品用于SDS-PAGE 分析。
 

3.   對照組不加誘導(dǎo)劑,實驗組加入IPTG至終濃度0.5 mmol/l,37℃繼續(xù)培養(yǎng)1-3h。
 

4.  12 000 rpm 離心10 min,棄上清,菌體沉淀保存于-20℃或-70℃冰箱中。
 

六、氯霉素?;D(zhuǎn)移酶重組蛋白的分離、純化
 

1.  NTA層析柱的準(zhǔn)備:在層析柱中加入1 mL NTA介質(zhì),并分別用8 mL 去離子水,8 mL上樣緩沖液洗滌。
 

2.  重組蛋白的變性裂解:在冰浴中凍融菌體沉淀,加入5 mL上樣緩沖液, 用吸管抽吸重懸,超聲波破裂菌體,用振蕩器等輕柔的混勻樣品60 min,4℃ 12000 rpm 離心 30 min,將上清吸至一個干凈的容器中,并棄沉淀。取10 ul 上清樣品用于SDS-PAGE 分析。
 

3.  上清樣品以10-15 mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流出液,取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
 

4.  洗脫雜蛋白:用Washing Buffer以10-15 mL/h流速洗柱,直至OD280 = 0.01分步收集洗脫液,約3-4 h,取10 ul洗脫開始時的樣品用于SDS-PAGE 分析。
 

5.  洗脫目標(biāo)蛋白:用Elution Buffer洗柱,收集每1 mL 級分,分別取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
 

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注意事項 
1.  選擇表達(dá)載體時,要根據(jù)所表達(dá)蛋白的終應(yīng)用考慮。如為方便純化,可選擇融合表達(dá);如為獲得天然蛋白,可選擇非融合表達(dá)。
 
2.  融合表達(dá)時在選擇外源DNA同載體分子連接反應(yīng)時,對轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯過程中密碼結(jié)構(gòu)的閱讀不能發(fā)生干擾。

3.  菌液OD值要小于1,否則細(xì)胞太濃太老,不易破碎,且質(zhì)粒易丟失。

4.  誘導(dǎo)時間做一個梯度,不同蛋白誘導(dǎo)時間需摸索。

5.  誘導(dǎo)溫度適當(dāng)摸索:25、30℃。

6.  IPTG濃度:一般在1 mM 以內(nèi),可適當(dāng)摸索。

7.  超聲條件可視實際情況改變,只要使菌體裂解充分即可,即菌液清亮不粘稠。
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其他 
一、原核表達(dá)

1.  原核表達(dá)簡介

將克隆化基因插入合適載體后導(dǎo)入大腸桿菌用于表達(dá)大量蛋白質(zhì)的方法一般稱為原核表達(dá)。這種方法在蛋白純化、定位及功能分析等方面都有應(yīng)用。

2.  大腸桿菌用于表達(dá)重組蛋白的特點
 
(1)易于生長和控制;

(2)用于細(xì)菌培養(yǎng)的材料不及哺乳動物細(xì)胞系統(tǒng)的材料昂貴;

(3)有各種各樣的大腸桿菌菌株及與之匹配的具各種特性的質(zhì)??晒┻x擇;

(4)在大腸桿菌中表達(dá)的蛋白由于缺少修飾和糖基化、磷酸化等翻譯后加工,常形成包涵體而影響表達(dá)蛋白的生物學(xué)活性及構(gòu)象。
 
3.  原核表達(dá)載體

通常為質(zhì)粒,典型的表達(dá)載體應(yīng)具有以下幾種元件:
 
(1)選擇標(biāo)志的編碼序列;
 
(2)可控轉(zhuǎn)錄的啟動子;
 
(3)轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列(轉(zhuǎn)錄終止子,核糖體結(jié)合位點);
 
(4)一個多限制酶切位點接頭;
 
(5)宿主體內(nèi)自主復(fù)制的序列。
 
4.  原核表達(dá)一般程序
 
獲得目的基因-準(zhǔn)備表達(dá)載體-將目的基因插入表達(dá)載體中(測序驗證)-轉(zhuǎn)化表達(dá)宿主菌-誘導(dǎo)靶蛋白的表達(dá)-表達(dá)蛋白的分析-擴增、純化、進(jìn)一步檢測



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