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上海雅吉生物科技有限公司
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水牛正痘病毒染料法熒光定量 PCR 試劑盒
2019-9-18 閱讀(265)
產(chǎn)品及特點 水牛正痘病毒(Buffalo Pox Virus,BPXV)是一種存在于上皮細胞屑中的病毒, 能
夠引發(fā)以體表無毛處皮膚痘疹,能夠使上呼吸道、口腔和食管部黏膜形成纖維素性壞死
假膜。該病毒對外界是環(huán)境的抵抗力相當強,在上皮細胞屑中的病毒,雖然*干燥和
被直射
使用方法 一、稀釋 PCR 陽性對照(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)
1. 注意:由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬
不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,
本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對
照。
2. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。
4. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩 1 分鐘,得
1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),
充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中,充分
震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備
8. 如果有 N 個樣品,必須設(shè)置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對照),
一個是 NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?10μL 上步制備的 PCR 陽性對照的第 4
號(濃度為 1×10E4 拷貝/μL,10μL 相當于 1 萬拷貝)或第 5 號(濃度為 1×10E5
拷貝/μL,10μL 相當于 10 萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求
的體積一樣,以此作為 PC。另外用水作為 NC。如果每次制備需要 200μL 樣品,
則 PC 和 NC 的體積也必須是 200μL。
9. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒 DNA 提取試劑盒兼
容。也可以選購本公司的一管式病毒 DNAout 或其升級版柱式病毒 DNAout。本
試劑盒免費贈送 15 次一管式病毒 DNAout。
三、設(shè)置 qPCR 反應(yīng)(20 μL 體系,在樣品制備室進行)
10. 如果只做 1 次重復(fù),則標記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個
樣品,1 個用于 PCR 陰性對照,6 個用于 PCR 陽性對照。如果做 2-3 次重復(fù),則
反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加 2 或 3 倍。
11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢
后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后后加):
成分
樣品管
N+2 個
PCR 陰性
對照管
PCR 陽性
對照管(2-7 管)
2×qPCR MagicMix
(棕色管)
10 μL 10 μL 各 10 μL
水牛正痘病毒 PCR
引物混合液(白蓋)
2 μL 2 μL 各 2 μL
自備 10×ROX (見注) 2 μL 2 μL 各 2 μL
N+2 待測樣品 DNA 模板 6 μL 不加 不加
第 7 步所得 PCR 陽性對照
稀釋液(2-7 號)
不加 不加
各 6μL(2 號樣到
2 號管,3 號樣到 3
號管…)
注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照,其他熒光 PCR 儀
器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene
3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX,則用水替代。
12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行 PCR(具體 PCR 參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行
優(yōu)化)。
過程 溫度 時間
預(yù)變性 94℃ 5 分鐘
PCR 反應(yīng)
(30 個循環(huán))
92℃ 60 秒
58℃ 60 秒
74℃ 60 秒
13. 數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合 DNA 時,
大吸收光譜在 471 nm,結(jié)合 DNA 時的大吸收光譜在 500 nm,大發(fā)射光
譜在 530 nm。信號采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱
軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 DNA 濃度的
log 值,再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等
于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于
30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為
陽性。如果在 35-40 之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實驗的 Ct 值如果大于或等于 40 則
為陰性,如果小于 40,則為陽性。
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