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全基因組測(cè)序解密慢性高原病

時(shí)間:2013-8-20閱讀:660
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由加州大學(xué)圣地亞哥分校、華大基因等單位共同完成的安第斯高地人慢性高原病全基因組測(cè)序及相關(guān)研究,在《美國(guó)人類遺傳學(xué)雜志》上發(fā)表。研究為探索高原適應(yīng)性的遺傳機(jī)制提供了基礎(chǔ)理論,也為慢性高山病的機(jī)理研究及治療提供了科學(xué)依據(jù)。

約有1.4億人世居高原。對(duì)于高原低氧環(huán)境的不適,通常會(huì)產(chǎn)生各種高原疾病,尤其生活在海拔3000米以上的人,通常會(huì)發(fā)生慢性高原病,表現(xiàn)為紅細(xì)胞增多,并出現(xiàn)一系列頭痛、乏力、嗜睡等癥狀。

研究人員對(duì)20個(gè)生活在高原地區(qū)的安第斯人進(jìn)行全基因組測(cè)序,其中包括10個(gè)慢性高原病患者和10個(gè)正常人。研究人員發(fā)現(xiàn)其基因組中,有11個(gè)區(qū)域存在明顯的單體型頻率差異并發(fā)生選擇性清除,暗示著這些區(qū)域受到強(qiáng)烈的正向自然選擇。在位于這些區(qū)域的基因中,相比于正常人群,在慢性高原病患者中ANP32D和SENP1兩個(gè)基因顯著高表達(dá)。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),當(dāng)果蠅中ANP32D和SENP1的同源基因表達(dá)下調(diào)時(shí),其在低氧環(huán)境下的存活率將顯著升高。據(jù)此,他們推測(cè),這些基因表達(dá)下調(diào)可能有利于對(duì)低氧環(huán)境下的適應(yīng)和耐受。

研究人員發(fā)現(xiàn),慢性高原病患者負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)紅細(xì)胞生成的基因SENP1表達(dá)上調(diào),可能在導(dǎo)致慢性高原病患者紅細(xì)胞增多的癥狀中扮演了重要角色。此外,ANP32D是已知的原癌基因,研究人員推測(cè)在慢性高山病患者中,該基因以用類似于在癌細(xì)胞中的方式來改變細(xì)胞代謝,從而使得低氧環(huán)境下細(xì)胞大量增殖。這些發(fā)現(xiàn)同時(shí)還將有助于揭示類似環(huán)境下發(fā)生的疾病病理機(jī)制,如心臟病、阻塞性睡眠呼吸暫停綜合征等。

科學(xué)家表示,通過強(qiáng)大的全基因組測(cè)序技術(shù)、體外培養(yǎng)的人細(xì)胞模型和果蠅活體模型的有機(jī)結(jié)合,不僅能夠鑒定出與缺氧耐受相關(guān)的基因,同時(shí)也對(duì)這些基因的功能進(jìn)行了系統(tǒng)的評(píng)估。這種研究策略將可用于發(fā)現(xiàn)更多疾病的致病基因。

 

來源:科技日?qǐng)?bào)

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