蛋白質(zhì)由許多氨基酸鏈組成，每一種氨基酸鏈都會制造出一種名為功能性基序的短鏈氨基酸序列，當功能性基序被修飾時，產(chǎn)生的突變就會影響疾病的發(fā)展，比如癌癥等疾病。驗證蛋白質(zhì)的可能性改變是深入理解其功能的*步，人類機體的蛋白質(zhì)組是由4萬個蛋白組成，因此尋找每一種蛋白的突變將是一項非常艱巨的任務(wù)。

這就是為何科學家開始尋找生物信息學工具進行研究的原因，來自巴斯克地區(qū)大學的研究者此前開發(fā)了一種名為WREGEX的軟件，其可以幫助預測并自動搜尋功能性的基序；研究者檢測了這種軟件預測基序的能力，基序可以將蛋白質(zhì)從細胞核移動到細胞質(zhì)中；如今研究人員想知道哪種蛋白質(zhì)氨基酸序列中含有功能性的癌癥突變基序。

刊登在Scientific Reports雜志上的一篇研究報告中，研究人員結(jié)合COSMIC目錄中所有已知的人類蛋白質(zhì)序列信息，并對相關(guān)信息進行了分許，COSMIC目錄中收集了和癌癥相關(guān)的突變，因此，基于版本的WREGEX 2.0軟件，研究者就可以將正常蛋白同相同的突變體進行對比來幫助預測可以被修飾的蛋白質(zhì)功能基序以及和癌癥相關(guān)的功能基序。

研究者Gorka Prieto說道，你或許想知道基序發(fā)揮功能的機制，并且發(fā)現(xiàn)是否蛋白質(zhì)的修飾和癌癥相關(guān)，如今利用我們開發(fā)的新型軟件或許就可以達到這些目的。文章中研究人員開發(fā)的新型工具結(jié)合了三種類型的信息，即蛋白質(zhì)序列、功能基序及癌癥突變，WREGEX 2.0軟件的一個主要特性就是其可以同時研究攜帶大量蛋白質(zhì)信息的高復復雜的蛋白質(zhì)組，并且結(jié)合相關(guān)的信息，比如癌癥突變信息等。

利用新型軟件的優(yōu)勢就是可以在1分鐘之內(nèi)完成對4萬個蛋白的分析，而其它軟件程序分析單一蛋白都需要花費幾分鐘時間。利用這種新型軟件科學家們或許就可以預測蛋白質(zhì)的改變?nèi)绾斡绊懚喾N疾病的發(fā)生，而不僅僅是癌癥。截至目前為止，來自中國、日本、德國等地的13個研究團隊已經(jīng)開始使用這種計算機工具，同時研究者希望后期可以進行更為深入的研究來改善這種工具的工作效率。