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當(dāng)前位置:上??ㄅ锟萍加邢薰?/a>>>公司動態(tài)>>分析蛋白?也許游戲才是的方法
游戲在某些人眼里也許是玩物喪志的東西,但是在另外一些人眼里,通過游戲也許能解開生物之謎,近期來自華盛頓大學(xué)的研究人員就利用一個蛋白折疊游戲構(gòu)建了蛋白模型,并用于開發(fā)艾滋病藥物。不僅如此,現(xiàn)在華盛頓大學(xué)的研究人員還通過700多玩家的實驗調(diào)查,分析了他們在解決蛋白結(jié)構(gòu)中運用的zui有效方法和運算法則。這一研究調(diào)查公布在《美國國家科學(xué)院院刊》(PNAS)雜志上。
這個游戲就是2008年華盛頓大學(xué)的計算機科學(xué)和工程學(xué)系和生物化學(xué)學(xué)系聯(lián)合開發(fā)的一個實驗性的蛋白質(zhì)折疊電子游戲——Foldit。分析蛋白質(zhì)分子如何折疊是一個復(fù)雜的過程,雖然大致的程序已經(jīng)為人所知,但蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測還是需要大量的運算。Foldit游戲就是讓玩家試著操縱簡單的類蛋白質(zhì)構(gòu)造,并定期更新以真實蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的謎題。簡單來說,就是在給定一個目標(biāo)蛋白質(zhì)后,玩家需要在遵守科學(xué)規(guī)律的前提下,用氨基酸如搭積木一樣把目標(biāo)蛋白質(zhì)“搭建”出來(游戲鏈接:目前這一游戲出的謎題都是基于已被人們清楚了解的蛋白質(zhì),但近期華盛頓大學(xué)的研究人員利用這個蛋白折疊游戲,破解了與猴類艾滋病病毒有關(guān)的蛋白:M-PMV。在這之前,不少研究人員試圖通過分子置換構(gòu)建M-PMV逆轉(zhuǎn)錄酶晶體結(jié)構(gòu),但都失敗了。在這項研究中,華盛頓大學(xué)研究人員于是把這個蛋白質(zhì)設(shè)為目標(biāo),放入Foldit游戲中,沒過多久,就有玩家找出了可能的氨基酸組裝方式。之后研究人員用X射線等對玩家給出的結(jié)果進行了驗證,發(fā)現(xiàn)這個玩出的結(jié)果是準(zhǔn)確的。這將有助于艾滋病病毒的深入解析,以及艾滋病藥物的研發(fā)。
不僅如此,在過去幾年里,有六萬人參與了Foldit這個游戲,一些分析幫助了癌癥和阿茲海默癥藥物的研究,那么其中會不會有一些值得參考的蛋白分析思路呢?
為了能更進一步從這個游戲中獲得對于蛋白結(jié)構(gòu)分析有幫助的信息,華盛頓大學(xué)的研究人員在三個月里,詳細(xì)分析了721位游戲玩家在游戲過程中采用的方法和運算法則,他們收集那些具有創(chuàng)新性的新方法,并希望能從中發(fā)現(xiàn)的運算方法。通過分析玩家們在解決蛋白結(jié)構(gòu)迷題中,采用的這些zui有效的方法,研究人員希望能整理這些復(fù)雜方法,廣泛用于解決科學(xué)難題。
文章作者表示,這項成果比艾滋病研究那項成果更讓我們激動,因為之前的論文還只是解決了一個長期困擾科學(xué)家的難題,而這項成果分析了玩家們?nèi)绾握业胶线m的策略方法,用于游戲,提升這些方法的效率。
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