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百螢問號:Western Blot實(shí)驗(yàn)中常見問題解答

時間:2024/3/25閱讀:105
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Western 免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,然后利用抗體進(jìn)行檢測的實(shí)驗(yàn)。在WB 實(shí)驗(yàn)中常會出現(xiàn)各種問題,而拖慢實(shí)驗(yàn)速度,使實(shí)驗(yàn)達(dá)不到理想的效果。今天百螢跟各位同學(xué)一起分享下 WB 實(shí)驗(yàn)中各種問題及問題建議。

常見問題

可能原因

建議

電泳條帶成笑臉狀

膠不均勻冷切,中間冷卻不好,電泳系統(tǒng)溫度偏高

減少電壓減慢電泳速度,在冷室或者冰浴中進(jìn)行電泳

電泳條帶成皺眉狀

可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不w全

調(diào)整裝置

拖尾

樣品溶解不好

樣品充分溶解混勻后上樣

紋理(縱向條紋)

樣品中含有不溶性顆粒

樣品充分?jǐn)嚢杌靹?/span>

條帶偏斜

電極不平衡或者加樣位置偏斜

調(diào)整電極和加樣

條帶兩邊擴(kuò)散

加樣量過多

適當(dāng)減少上樣量

Marker 變黑色

抗體和 Marker 蛋白反應(yīng)

Marker 和 sample 之間空出一個孔不上樣

背景高

膜封閉不夠

延長封閉時間,選擇適宜的抗體稀釋度

一抗稀釋度不適宜

對抗體進(jìn)行滴度測試,選擇適宜的抗體稀釋度

一抗孵育的溫度偏高

建議 4℃ 結(jié)合過夜

二抗?jié)舛榷冗^高

降低二抗?jié)舛?/span>

二抗的非特異性背景

增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗(yàn)證背景是否是由于二抗所致??蛇x擇其它二抗(特異性更強(qiáng)的,只針對重鏈)

二抗孵育時間過久

減少二抗孵育時間

選擇膜的問題

硝酸纖維素的背景會比 PVDF 膜低

膜在實(shí)驗(yàn)過程中干過

實(shí)驗(yàn)過程中要注意保持膜的濕潤

檢測時曝光時間過長

注意曝光時間的縮短

洗膜不充分

增加洗膜的時間和次數(shù)

抗體和封閉蛋白有交叉反應(yīng)

檢測抗體與封閉蛋白的交叉反應(yīng)性,選擇無交叉反應(yīng)的封閉劑。洗滌液中加入 Tween-20 可減少交叉反應(yīng)

雜帶較多

目的蛋白有多個修飾位點(diǎn)(磷酸化位點(diǎn),糖基化位點(diǎn),乙?;稽c(diǎn)等),本身可以呈現(xiàn)多條帶

查閱文獻(xiàn)或進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點(diǎn)信息,通過去修飾確定蛋白試劑大小

目的蛋白有其他剪切本

查閱文獻(xiàn)或生物信息學(xué)分析可能性

樣品處理過程中目的蛋白發(fā)生降解

裂解液中加入蛋白酶抑制劑,樣品處理在冰上進(jìn)行

上樣量過高,太敏感

適當(dāng)減少上樣量

一抗不純

純化抗體

一抗特異性不高

重新選擇或制備高特異性的抗體

二抗的非特異性結(jié)合

增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗(yàn)證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗(特異性更強(qiáng)的,只針對重鏈)

一抗或二抗?jié)舛绕?/span>

降低抗體濃度

細(xì)胞傳代較多,導(dǎo)致蛋白變異

使用原代或傳代少的細(xì)胞作對照

蛋白條帶位置

(大小)不對

二聚體或多聚體存在

增加蛋白質(zhì)變性過程及強(qiáng)度

翻譯后剪切

比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的,在執(zhí)行功能時需要進(jìn)行剪切成活化的形式

相對電荷

氨基酸電荷的組成

蛋白修飾

比如糖基化、磷酸化等修飾狀態(tài)會導(dǎo)致蛋白分子量增加

膠濃度

不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差

無蛋白條帶

抗體孵育不充分

增加抗體濃度,延長孵育時間

酶失活

直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物

標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低

設(shè)置陽性對照,如果陽性對照有結(jié)果,但標(biāo)本沒有則可能是標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低??煽紤]增加標(biāo)本上樣量解決靶蛋白含量低的原因

試劑之間不匹配

一抗與組織種屬,一抗與二抗或/和底物與酶系統(tǒng)之間不匹配。通過設(shè)置內(nèi)參照可以驗(yàn)證二級檢測系統(tǒng)的有效性

一抗失效

選擇在有效期內(nèi)抗體,幷選擇現(xiàn)配現(xiàn)用的工作液

HRP 抑制劑

所用溶液和容器內(nèi)避免含有疊D化鈉

抗體不能識別測試種屬的相關(guān)蛋白

購買抗體前應(yīng)認(rèn)真閱讀抗體說明書,確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應(yīng)蛋白

二抗與一抗不匹配

選擇針對一抗來源種屬的抗體

蛋白條帶信號弱

抗體孵育不充分

增加抗體濃度,延長孵育時間

酶活性降低

直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物

洗膜過度

洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強(qiáng)或過多,建議使用 0.1% 的弱去垢劑 Tween-20

標(biāo)本中靶蛋白含量太低

增加樣本上樣量

抗體活性降低

選擇有效期內(nèi)的抗體,工作液現(xiàn)配現(xiàn)用,避免長時間放置

蛋白轉(zhuǎn)移不充分

可以用麗春紅染膜幷結(jié)合染膠(考馬斯藍(lán))后確定條帶是否轉(zhuǎn)移到膜上或轉(zhuǎn)移過度,適當(dāng)調(diào)整轉(zhuǎn)膜的時間和電流

封閉過度

減少封閉劑的量或縮短時間,換用不同封閉劑類型

曝光時間過短

延長曝光時間

HRP 抑制劑

所用溶液和容器內(nèi)避免含有疊D化鈉

背景有黑色斑點(diǎn)

抗體與封閉試劑反應(yīng)

使用前過濾封閉試劑

HRP 偶聯(lián)二抗中有聚集體

過濾二抗試劑,去除聚集體

暗背景上白色帶

HRP 含量過高

降低酶聯(lián)二抗的濃度

背景有不均勻的白色斑點(diǎn)

轉(zhuǎn)膜過程中有氣泡存在

仔細(xì)檢測,避免存在氣泡

抗體分布不均勻

孵育抗體時使用搖床







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