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初級(jí)會(huì)員 | 第5年

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藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇

時(shí)間:2024/6/26閱讀:128
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  注:PE和APC的完整操作步驟及標(biāo)記方案在最后兩頁(yè),如果不需要看介紹,可直接跳過(guò)
  藻紅蛋白(R-PE及B-PE)
  特點(diǎn):
  1.從紅藻中純化
  2.具有高的發(fā)射量子產(chǎn)率
  3.熒光團(tuán)與蛋白質(zhì)主鏈共價(jià)結(jié)合,不被淬滅
  4.高水溶性
  R-PE與B-PE的區(qū)別:

藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇
  Wavelength(nm)

藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇
  Wavelerngn(mm)
  R-PE與B-PE的對(duì)比:

R-PE

B-PE

分子量

240,000

240,000

最大吸收

565 nm

545 nm

額外的吸收峰

498 nm

564nm

最大發(fā)射

573 nm

573 nm

消光系數(shù)(ε)

1.96x106 M-1cm-1

2.41x106 M-1cm-1

熒光量子產(chǎn)率(QY)

0.84

0.98

吸收比

A566/A280≥5.0

A566/A498<1.5

A620/A566<0.01

A545/A280≥5.5

A565/A496<2.7

A620/A545<0.01

  特點(diǎn):
  1.從藍(lán)藻中純化
  2.具有高的發(fā)射量子產(chǎn)率
  3.熒光團(tuán)與蛋白質(zhì)主鏈共價(jià)結(jié)合,不被淬滅
  4.高水溶性
  APC和C-PC的區(qū)別:
藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇
  APC和C-PC的對(duì)比:

APC

C-PC

分子量

104,000

264,000

最大吸收

651nm

651nm

最大發(fā)射

662nm

647 nm

消光系數(shù)(?)

7.3x105 M-1cm-1

1.53x106cm-1M-1

熒光量子產(chǎn)率(QY)

0.68

0.81

吸收比

A650/A620≥1.25

A650/A280≥4.5

A652/A620<0.3

A620/A280>4

  交聯(lián)APC和APC的對(duì)比:
  1.APC結(jié)構(gòu):它具有α和β亞基,具有明顯的(αβ)3四級(jí)結(jié)構(gòu)。
  2.為什么要將APC進(jìn)行交聯(lián)?答:交聯(lián)是為了防止APC在稀釋或暴露于變性鹽(如尿素或鹽酸胍)時(shí)發(fā)生可逆解離,從而保持其結(jié)構(gòu)和功能穩(wěn)定。
  3.如何進(jìn)行APC交聯(lián)?答:通過(guò)α和β亞基間的特異性交聯(lián)可以阻止APC的分解。
藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇
  交聯(lián)比:>1.0

NaClO4

A650:A620

CL-APC

1.465849387

CL-APC+NaClO4

+

1.386850153/

NaClO4

A650:A620

APC

1.587272727

APC+NaClO4

+

0.317901235

  注:圖中的紅色線條為沒(méi)有添加NaClO4,藍(lán)色線條為添加了NaClO4。
  如圖及表中信息所示,CL-APC圖中添加NaClO4及沒(méi)添加NaClO4,吸收比沒(méi)有明顯變化。而在未交聯(lián)的APC中,添加NaClO4,得到的吸收比有非常大的變化,因?yàn)锳PC中加入了NaClO4導(dǎo)致了它出現(xiàn)了解離。
  特點(diǎn):
  1.存在于大多數(shù)光合作用的甲藻中
  2.高水溶性
  3.大斯托克斯位移
  光譜特性:

PerCP

分子量

35,000

最大吸收

483nm

最大發(fā)射

676nm

消光系數(shù)(ε)

4.0x105 M-1cm-1

熒光量子產(chǎn)率(QY)

1.0

亮度(exQY)

4.9x105M-1cm-1

吸收比

A482/A280>4.0

  一、PE的制備
  1.將PE純化。綴合前的濃度通常為5-10mg/ml。注意:PE在綴合前作為SAS(硫酸銨鈉)沉淀物穩(wěn)定。如果將PE以SAS沉淀物的形式儲(chǔ)存,則必須在使用前進(jìn)行大量純化。
  2.使用3.5毫克R-PE修飾每毫克lgG,包括在緩沖液交換過(guò)程中損失的額外10%。
  3.檢查PE的純度和濃度,請(qǐng)測(cè)量280、565和620nm處的吸光度。(1mg/ml的PE在565nm處的OD為8.2)。565/620比率>50表示已充分去除污染的藻藍(lán)蛋白;565/280比率> 5表示已充分去除所有其他蛋白質(zhì)。
藻膽蛋白的自我介紹之藻紅蛋白篇
  二、PE的活化
  1.使用前在無(wú)水DMSO中制備10mg/ml的SMCC儲(chǔ)備溶液。
  2.每毫克PE加入11μlSMCC,并進(jìn)行渦旋。將反應(yīng)管用鋁箔包好,室溫下旋轉(zhuǎn)60分鐘。
  3.將純化的PE過(guò)凝膠過(guò)濾柱來(lái)交換緩沖液。
  注意:對(duì)于失敗或效果較差的結(jié)合,增加或減少SMCC相對(duì)于PE的量,可能會(huì)有所好轉(zhuǎn)。
  三、1gG還原
  1.在蒸餾水中制備1MDTT(15.4mg/100μl)的新鮮溶液。
  2.1gG溶液濃度應(yīng)為4mg/ml或更高,這樣效果比較好。還原幾乎可以在任何緩沖液中進(jìn)行;MES、磷酸鹽和TRIS緩沖液(pH范圍為6至8)已被驗(yàn)證可以使用。如果抗體濃度低于2mg/ml,則應(yīng)濃縮。緩沖液交換柱上的損失應(yīng)額外增加10%。
  3.用DTT配制20mMlgG溶液:每毫升IgG溶液加入20μlDTT原液并攪拌。室溫下靜置30分鐘無(wú)需額外攪拌(以盡量減少半胱an酸再氧化為胱an酸)。
  4.將還原的lgG通過(guò)預(yù)平衡的“交換緩沖液"過(guò)濾柱。收集0.25毫升的級(jí)分,測(cè)定蛋白濃度,并將含有大部分lgG的級(jí)分匯集在一起。可以通過(guò)分光光度法或比色法完成。
  5.此步驟后盡快進(jìn)行綴合。
  注意:對(duì)于結(jié)合較差或失敗的情況,降低DTT濃度可能會(huì)有所幫助。
  四、進(jìn)行綴合
  1.每毫克IgG添加3.2毫克SMCC-PE。用鋁箔包裹反應(yīng)管并在室溫下旋轉(zhuǎn)60分鐘。注意:這些摩爾比(每IgG約2個(gè)PE)效果很好。對(duì)于失敗或效果不佳的結(jié)合,不同的摩爾比可能會(huì)有所幫助。
  2.60分鐘后,必須去掉lgG上未反應(yīng)的游離巰基。
  3.在1.0ml干DMSO中制備10mgNEM的新鮮溶液。
  4.每毫克|gG添加34μg(3.4μl)。室溫下包裹并旋轉(zhuǎn)20分鐘。
  2.60分鐘后,必須去掉lgG上未反應(yīng)的游離巰基。
  3.在1.0ml干DMSO中制備10mgNEM的新鮮溶液。
  4.每毫克|gG添加34μg(3.4μl)。室溫下包裹并旋轉(zhuǎn)20分鐘。
  注1:整個(gè)綴合過(guò)程可以在一天內(nèi)完成。但是,綴合前對(duì)APC的純化可能需要24-48小時(shí)。除了下面列出的材料外,您還需要濃度至少為2mg/ml的抗體溶液。請(qǐng)您在進(jìn)行APC抗體綴合實(shí)驗(yàn)之前熟悉如何使用脫鹽柱以及如何獲取吸光度光譜。
  注2:SMCC-APC綴合物非常穩(wěn)定(在“交換緩沖液"中,在4C下至少可以穩(wěn)定幾個(gè)月)。因此,如果您需要節(jié)省一部分時(shí)間,可以選擇同時(shí)綴合10毫克或更多的APC,并將其用于幾次抗體實(shí)驗(yàn)(在幾周內(nèi))。SMCC-APC的長(zhǎng)期儲(chǔ)存最好是作為飽和硫酸銨沉淀物。
  一、APC的制備
  1.將APC純化。綴合前的濃度通常為5-10mg/ml。注意:APC在綴合前作為SAS(硫酸銨鈉)沉淀物穩(wěn)定。如果將APC以SAS沉淀物的形式儲(chǔ)存,則必須在使用前進(jìn)行大量純化。在用每毫升1升的“透析緩沖液"透析之前,用每毫升1升APC的PBS進(jìn)行透析2次。
  2.使用1.7毫克APC修飾每毫克lgG,包括在緩沖液交換過(guò)程中損失的額外10%。
  3.檢查APC的純度和濃度,請(qǐng)測(cè)量280、620和655nm處的吸光度。(1mg/ml的APC在655nm處的OD為5.9)。655/620比率>1.4表明雜質(zhì)被充分去除;655/280比率>4表明所有其他蛋白質(zhì)均已充分去除
  二、APC的活化
  1.使用前在無(wú)水DMSO中制備10mg/ml的SMCC儲(chǔ)備溶液。
  2.每毫克APC加6μlSMCC,并進(jìn)行渦旋。將反應(yīng)管用鋁箔包好,室溫下旋轉(zhuǎn)60分鐘。
  3.將純化的APC過(guò)凝膠過(guò)濾柱來(lái)交換緩沖液。
  注意:對(duì)于失敗或效果較差的結(jié)合,增加或減少SMCC相對(duì)于APC的量,可能會(huì)有所好轉(zhuǎn)。
  三、1gG還原
  1.在蒸餾水中制備1MDTT(15.4mg/100μl)的新鮮溶液。
  2.1gG溶液濃度應(yīng)為4mg/ml或更高,這樣效果比較好。還原幾乎可以在任何緩沖液中進(jìn)行;MES、磷酸鹽和TRIS緩沖液(pH范圍為6至8)已被驗(yàn)證可以使用。如果抗體濃度低于2mg/ml,則應(yīng)濃縮。緩沖液交換柱上的損失應(yīng)額外增加10%。
  3.用DTT配制20mMlgG溶液:每毫升IgG溶液加入20μlDTT原液并攪拌。室溫下靜置30分鐘,無(wú)需額外攪拌(以盡量減少半胱an酸再氧化為胱an酸)。
  4.將還原的lgG通過(guò)預(yù)平衡的“交換緩沖液"過(guò)濾柱。收集0.25毫升的級(jí)分,測(cè)定蛋白濃度,并將含有大部分lgG的級(jí)分匯集在一起??梢酝ㄟ^(guò)分光光度法或比色法完成。
  5.此步驟后盡快進(jìn)行綴合。
  注意:對(duì)于結(jié)合較差或失敗的情況,降低DTT濃度可能會(huì)有所幫助。
  四、進(jìn)行綴合
  1.每毫克IgG添加1.5毫克SMCC-APC。用鋁箔包裹反應(yīng)管并在室溫下旋轉(zhuǎn)60分鐘。注意:這些摩爾比(每1gG約2個(gè)APC)效果很好。對(duì)于失敗或效果不佳的結(jié)合,不同的摩爾比可能會(huì)有所幫助。
  2.60分鐘后,必須去掉lgG上未反應(yīng)的游離巰基。
  3.在1.0ml干DMSO中制備10mgNEM的新鮮溶液。
  4.每毫克|gG添加34μg(3.4μl)。室溫下包裹并旋轉(zhuǎn)20分鐘。
  2.60分鐘后,必須去掉lgG上未反應(yīng)的游離巰基。
  3.在1.0ml干DMSO中制備10mgNEM的新鮮溶液。
  4.每毫克|gG添加34μg(3.4μl)。室溫下包裹并旋轉(zhuǎn)20分鐘。


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