zui大規(guī)模癌癥基因組研究

來(lái)自上海雙博生物科技有限公司的消息，癌癥基因組圖譜研究（Cancer Genome Atlas，TCGA）項(xiàng)目組公布了一項(xiàng)癌癥基因組zui大規(guī)模研究結(jié)果，研究人員在多個(gè)基因組技術(shù)平臺(tái)上分析了超過(guò)3500個(gè)腫瘤，從中發(fā)現(xiàn)了一種能區(qū)分癌癥的新方法。

2007年，美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院NIH宣布進(jìn)行為期兩年、總值340萬(wàn)美元的癌癥基因組圖譜研究計(jì)劃（Cancer Genome Atlas pilot program），這一計(jì)劃目標(biāo)是“測(cè)試一種大規(guī)模、系統(tǒng)性分析癌細(xì)胞基因組變化的方法的可行性”，為檢測(cè)、治療、預(yù)防癌癥提供基因組信息。

在過(guò)去的幾年里，這一項(xiàng)目陸續(xù)獲得了一些研究成果，而在這項(xiàng)研究中，研究人員采用6種不同的TCGA“平臺(tái)技術(shù)（platform technologies）”，分析了12種不同腫瘤類型樣品的DNA，RNA和蛋白，希望能從中發(fā)現(xiàn)不同類型的腫瘤如何相互區(qū)分。

研究結(jié)果表明相對(duì)于癌癥起源的組織類型，如乳房腎臟、膀胱等，相同癌癥起源的細(xì)胞類型具有更多分子和遺傳上的相似性。

我們組織中大部分是由許多不同類型的上皮細(xì)胞和非上皮細(xì)胞組成，“這項(xiàng)顛覆性的基因組研究不僅挑戰(zhàn)了基于組織類型的現(xiàn)有癌癥分類系統(tǒng)，而且還提供了能用于進(jìn)一步研究的大量新數(shù)據(jù)來(lái)源，以及能用于區(qū)分每種新描述癌癥類型的分子特征整體列表，”研究人員說(shuō)，“比如說(shuō)膀胱癌能重新被分成幾種不同的癌癥類型，每一種都具有不同的臨床表征，這就有助于解釋對(duì)看似相同的癌癥類型進(jìn)行相同的全身療法治療，為什么患者往往反應(yīng)截然不同”。

這一研究組發(fā)現(xiàn)在十個(gè)癌癥患者中至少有一個(gè)能通過(guò)這種新系統(tǒng)分類到不同的癌癥類型中，而且Benz認(rèn)為如果他們下一輪進(jìn)行更多的樣品，和腫瘤類型的分析，將會(huì)有更多的腫瘤需要重新分類，他預(yù)計(jì)下一輪將進(jìn)行超過(guò)20種不同腫瘤類型的分析。

在這項(xiàng)研究中，zui引人注目的發(fā)現(xiàn)就是膀胱癌和乳腺癌方面的成果，至少有三個(gè)不同亞型的膀胱癌需要重新分類：一種是無(wú)法與肺腺癌區(qū)分開(kāi)來(lái)的亞型，一種是與起源自頭部，頸部和肺部的鱗狀上皮細(xì)胞癌很相似的亞型。

這項(xiàng)研究也指出和證實(shí)了乳腺癌類型中已知的差異，而且還揭示出了新的令人驚訝的發(fā)現(xiàn)——基底樣乳腺癌實(shí)際上是一類新癌癥類型。

基底樣乳腺癌（Basal-like breast cancers）通常稱為三陰性乳腺癌（triple-negative breast cancer），是一種特別具有侵襲性，并致命的癌癥。