非洲豬瘟(African swine fever, ASF)于1921年在肯尼亞*被發(fā)現(xiàn),是一種高度傳染性的豬病毒性疾病,依據(jù)強(qiáng)毒性的病毒分離株測(cè)得的死亡率接近%。在過去的十年中,ASF已傳播到高加索、俄羅斯聯(lián)邦和東歐的許多國家,這構(gòu)成了進(jìn)一步傳播的嚴(yán)重風(fēng)險(xiǎn)。在 2019年1月至2019年9月期間,26個(gè)國家向世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(World Organization for Animal Health, OIE)通報(bào)了新的或正在發(fā)生的疫情:歐洲13個(gè)國家,亞洲10個(gè)國家,非洲3個(gè)國家。在沒有疫苗或治療方法的情況下,撲殺豬是控制疫情爆發(fā)的效方法,在2018 ~2019年間有超過3000萬頭豬被撲殺。據(jù)估計(jì),ASF大流行給養(yǎng)豬業(yè)造成了20億美元的經(jīng)濟(jì)損失。作為導(dǎo)致ASF的病毒,非洲豬瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)在環(huán)境中穩(wěn)定,可在豬之間快速有效地傳播。
ASFV靶向巨噬細(xì)胞,即主要存在于血液和骨髓中的單核細(xì)胞。在一項(xiàng)新的研究中,來自中國生物物理研究所、中國大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)、上??萍即髮W(xué)、清華大學(xué)和南開大學(xué)的研究人員從30~40天大的無特定病原體(specific pathogen-free, SPF)豬中 分離出豬骨髓細(xì)胞(PBM細(xì)胞),然后在原代PBM細(xì)胞中進(jìn)行ASFV(從中國一個(gè)爆發(fā)ASF流行病的農(nóng)場(chǎng)的豬脾樣本中分離出的毒株HLJ-2018)增殖,從細(xì)胞上清液中純化出細(xì)胞外ASFV病毒顆粒,然后用甲醛滅活這些病毒顆粒。他們利用低溫電鏡(cryo-EM)研究了這些純化 出的病毒顆粒。細(xì)胞外ASFV病毒顆粒的平均直徑為260~300 nm,比以前的觀察結(jié)果(大約200 nm)大得多,這可能是由于病毒顆粒不完整或在低溫電鏡觀察之前對(duì)樣品進(jìn)行了脫水處理。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Architecture of African swine fever virus and implications for viral assembly”。論文通訊作者為中國農(nóng)業(yè)哈爾濱獸醫(yī)研究所所長(zhǎng)步志高(Zhigao Bu),中國院士饒子和(Zihe Rao)和中國研究員王祥喜(Xiangxi Wang)。
像大多數(shù)核質(zhì)大DNA病毒(NCLDV)一樣,ASFV病毒顆粒的大小(直徑250~500 nm)和潛在的柔性將它的結(jié)構(gòu)解析分辨率限制在10Å(埃米,納米的十分之一)以下。在這項(xiàng)新的研究中,這些研究人員通過對(duì)43811個(gè)ASFV病毒顆粒進(jìn)行均化處理,獲得了分辨率為8.8Å的二 十面體ASFV重建結(jié)構(gòu)圖。該三維重建結(jié)構(gòu)圖清楚地顯示了ASFV的所有五個(gè)層的結(jié)構(gòu),其中衣殼(第四層)的大直徑為250 nm,第三層是70Å厚的脂質(zhì)雙層膜,它包裹著直徑180納米的核殼(第二層)。這三層呈現(xiàn)整體二十面體形態(tài),大致遵循衣殼確定的輪廓。然而,由 于二十面體均化處理導(dǎo)致的某些結(jié)構(gòu)特征的丟失,外層的外囊膜和內(nèi)層的類核呈現(xiàn)較弱的密度。
結(jié)合以前的實(shí)驗(yàn)觀察和這項(xiàng)研究中的結(jié)構(gòu)分析以及這項(xiàng)研究中的發(fā)現(xiàn),這些研究人員提出詳細(xì)的假設(shè),以進(jìn)一步理解ASFV衣殼組裝。首先,p49與膜結(jié)合的能力介導(dǎo)了五鄰體復(fù)合物??吭趦?nèi)膜上,在那里,它招募?xì)ち#╝)形成五鄰體核心,從而啟動(dòng)組裝。這與巨型病毒 mivirvirus衣殼的體內(nèi)組裝相一致,后者從五重頂點(diǎn)開始,逐步完成衣殼組裝。其次,具有兩個(gè)殼粒對(duì)(b-c和B-C)的骨架單元M1249L附著在五鄰體核心上,與此同時(shí),這些骨架單元、五鄰體核心和p17可以在內(nèi)膜上移動(dòng),從而增加了它們形成更高階組裝的機(jī)會(huì)。在p17的引導(dǎo)下,殼粒、骨架蛋白M1249L和p17有助于拉鏈結(jié)構(gòu)的形成,這些拉鏈結(jié)構(gòu)連接相鄰的五鄰體核心并逐漸構(gòu)建多面體框架。伴隨多面體框架的形成,殼粒填充重對(duì)稱殼粒聚集體以完成衣殼組裝。在這種模型中,骨架蛋白M1249L充當(dāng)構(gòu)建衣殼框架的骨架,并確 定著衣殼的尺寸。與此相一致的是,在病毒PRD-1、PBCV-1和Bam35中也觀察到了具有類似功能的纖維狀蛋白,這表明了存在類似的組裝途徑。