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感受態(tài)細胞的制備和重組質粒的轉化

時間:2014-6-30閱讀:9604
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質粒在不同的細菌之間轉移是微生物世界中一種普遍的現(xiàn)象,一個細菌品系通過吸收另一個細菌品系的質粒DNA而發(fā)生了遺傳性狀的改變,這種現(xiàn)象叫做轉化,獲得了外源DNA的細胞稱為轉化子。

在基因克隆技術中,所謂轉化是指質?;蛑亟M質粒被導入受體細胞,表達相應的選擇標記基因,并在一定的培養(yǎng)條件下,在選擇性培養(yǎng)基上長出轉化子的過程。質粒必須通過轉化進入細菌細胞內,才能進行擴增和表達,從而獲得大量的克隆基因,使我們能夠進行進一步的DNA操作,如亞克隆等;或者獲得其表達產物。轉化效率的高低與受體菌的生理狀態(tài)有關。細菌吸收外源DNA的能力zui高時的狀態(tài)被稱為感受態(tài)細胞(competent cell)。有些種類的細菌在其生長的任一階段都處于感受態(tài),而另一些細菌只有處于某個生長時期時(一般為對數(shù)生長早、中期),才會處于感受態(tài),如本實驗所用的大腸桿菌。用一定濃度的CaCl2 處理對數(shù)生長早中期的細菌可以大大提高細菌吸收周圍環(huán)境中的DNA分子的能力。對這種現(xiàn)象的一種解釋是CaCl2能使細菌細胞壁的通透性增強,從而提高轉化率。這種轉化方法稱為“化學法”。目前還可以使用電激的方法,通過瞬間的高壓電流,在細胞上形成孔洞,使外源DNA進入胞內,從而實現(xiàn)細胞的轉化。電激轉化的效率往往比化學法高出1到2個數(shù)量級,達到1 x 108轉化子/μg DNA,甚至1 x 109轉化子/μg DNA,所以常用于文庫構建時的轉化或遺傳篩選。

微生物轉化是基因工程的常用技術,大腸桿菌是基因工程中zui常用的受體菌,本實驗即是用前面實驗獲得的重組質粒轉化大腸桿菌細胞。

【試劑與器材】
<一>試劑
1.LB液體培養(yǎng)基: 參見附錄
每組配200mL, 其中100mL分裝于500mL三角瓶中,另各取3mL裝于2只大試管中,其余裝于裝于500mL三角瓶中,121℃高壓蒸汽滅菌20分鐘。
2.LB/Amp/IPTG/X-Gal平板(1):
配1L LB液體培養(yǎng)基,加入20g瓊脂粉和1支攪拌棒,同上高壓滅菌,趁熱取出置攪拌器上冷卻,待冷至55℃左右, 加氨芐(Ampicillin)至終濃度100μg/ml (Amp儲存液一般為100mg/mL), 倒平板,每皿倒約15 mL,室溫放置過夜至冷凝水揮發(fā)干凈。使用前半小時在培養(yǎng)基表面加20μL 50mg/mL X-gal和100μL 0.1mol/L IPTG,涂勻,待這兩種化合物滲入瓊脂后,即可用于轉化菌的涂布。
每組制備LB平板2個,LB/Amp 平板5個,LB/Amp/IPTG/X-Gal平板6個。
3.IPTG儲存液(0.1mol/L):1.2g IPTG加水至50ml,過濾除菌,4℃儲存。
4.X-gal儲存液:50mg/ml溶于二甲基甲酰胺溶劑中,過濾除菌,4℃儲存。
5.1 mol/L CaCl2儲存液,使用濃度為0.1mol/L,CaCl2應使用分析純,配100mL,高壓滅菌,全班用。
6.甘油(滅菌),全班50mL,同上高壓滅菌。
7.酸洗無菌玻璃珠,涂布平板用,用50mL三角瓶分裝,同上高壓滅菌,烘干備用。

<二>器材
1. 37℃溫箱、水浴鍋、恒溫振蕩器等
2. 高速冷凍離心機
3. 微量移液器等

<三>菌株 大腸桿菌DH5α,基因型為

【操作方法】
1、感受態(tài)細胞的制備(無菌操作):
1)從新鮮培養(yǎng)的LB平板上挑單個DH5α大菌落接種到3 mL LB培養(yǎng)液中(2),37℃劇烈振蕩(210-240r/min)培養(yǎng)過夜(3)。
2)取1mL過夜培養(yǎng)物, 接種到含100mL LB培養(yǎng)液的500 mL錐瓶中,37℃劇烈振蕩,直至培養(yǎng)液中細菌濃度達到OD600為0.375-0.4 (4)
3)培養(yǎng)物轉入2只50mL離心管中,冰上放置10分鐘 ,4,000r/min, 4℃離心15分鐘,棄上清(5)。
4)將菌體懸浮于10~20mL預冷的0.1mol/L CaCl2 溶液中, 冰上放置20分鐘(6)。
5)4,000rpm, 4℃,離心10分鐘,棄上清,然后將細菌輕輕懸浮在2ml 0.1mol/L CaCl2 溶液中(7)。若不立即進行轉化實驗,則進行第6步操作,反之,則進入轉化操作。
6)緩慢滴入甘油(滅菌)至終濃度為15%, 輕柔混勻,將細菌分裝成0.5ml/每管,立即液氮冷凍,轉入-70℃冰箱儲存,可在2個月內使用(8)。

2、感受態(tài)細胞的轉化
1)設計好實驗項目,如正、負對照(參考如下表格,按表格內容操作);
六  感受態(tài)細胞的制備和重組質粒的轉化
2)從-80℃冰箱中取出分裝成0.5mL/每管的感受態(tài)細胞, 置冰上5分鐘或緩慢流水淋至剛好解凍(10) ,立即分裝到預冷的1.5mL離心管中,每管體積參見上表,插入冰上待用;
3)對轉化管,加入連接產物DNA溶液,輕輕混勻;為保險起見,也可先加入一半的連接產物DNA溶液,輕輕混勻,剩下的一半置 -20℃冰箱保存;
4)冰上放置30分鐘(11);
5)放入42℃水浴中,熱激40秒(12);
6)迅速插入冰上,放置5分鐘;
7)對第1、2項,加入500μL LB培養(yǎng)基,其余加入250μL LB培養(yǎng)基, 37℃震蕩培養(yǎng)1小時(13);
8)對第1項,各取200μL直接用玻璃珠涂布于2個LB/ Amp/IPTG/X-Gal平板上;對第2項,分別取3、30 和100μL細菌培養(yǎng)液,各加無菌水至150μL(不超過200μL)涂LB/ Amp/IPTG/X-Gal平板(此步驟的目的是計算轉化率);對其余各項,分別各取一半涂布于LB/ Amp平板上,余下的轉化液置4℃冰箱保存(14)。倒置平板,37℃培養(yǎng)12-14小時。一般來說,含有活性半乳糖苷酶的細菌比無活性酶的細菌生長慢,故過夜培養(yǎng)后可見到毫米大小的陽性白色菌落而陰性的蘭色菌落只有針尖大小(15)。
9)挑取白色菌落進行鑒定(見下一個實驗)。

【注意事項與提示】
(1)倒平板時應避免培養(yǎng)基溫度過高,若溫度過高,則加入的氨芐會失效,且培養(yǎng)基凝固后表面及皿蓋會形成大量冷凝水,易于造成污染及影響單菌落的形成。若用手掌感受培養(yǎng)基覺得很燙但尚可忍受時,培養(yǎng)基溫度即為55℃左右。制備好的LB/Amp平板可于4℃冰箱儲存2個月,時間過長氨芐將會失效。加了IPTG/X-Gal的LB/Amp平板現(xiàn)用。
(2)DH5α在平板上過夜生長后,可置冰箱中保存一個月左右;接種新鮮的菌落或菌液有利于細菌細胞的同步快速生長,從而使細菌群體在達到一定的OD值后(0.375)大部分細胞都處于感受態(tài)。
(3)DH5α的生長需要氧氣,劇烈振蕩的目的是提高培養(yǎng)基的溶氧量以利于細菌的生長
(4)達到細菌對數(shù)生長早、中期,需時約2.0~2.5小時,此步驟至為關鍵,若超過此階段,則轉化效率急劇下降。
(5)低溫操作的目的是使細胞不再生長,保持其感受態(tài)。
(6)此步驟的目的是洗滌細胞。
(7)此時細胞較脆,懸浮時動作要輕,可用移液槍輕輕吸打。
(8)-70℃冰箱儲存的感受態(tài)細胞在6-8周后,轉化率很快降低??捎靡灰阎獦藴始皾舛鹊拈]環(huán)質粒如pUC18/19鑒定感受態(tài)細胞的轉化能力。
(9)實驗中一定要設計正負對照,如用無DNA轉化物的感受態(tài)細菌鋪板,若有菌落生長,說明其中抗生素濃度不夠或感受態(tài)細胞已被污染。加樣時速度要快,但要有條不紊,切勿加錯!加完樣用槍尖稍攪勻。第1項中所加連接產物的量可根據(jù)連接反應的終體積而定,一般加一半或2/3,其余置-20℃保存。
(10)從-80℃冰箱中取出冷凍的指管后,也可用雙手搓指管,利用掌心的溫度解凍。解凍時間勿過長。
(11)至少30min,可延長至1h左右。
(12)掌握時間,過長會致死細胞。在許多實驗方案中,熱激時間設為90至120秒,目前已有實驗證明如此長的熱激時間是沒有必要的,且會引起轉化效率的下降 。熱激前加入相當于轉化液體積1/10的DMSO可提高轉化效率10倍左右,加入DMSO后請勿再劇烈振蕩。
(13)此步驟使得細菌恢復正常并讓β-內酰氨酶基因表達。
(14)此步驟可在實驗出現(xiàn)錯誤后進行補救。
(15)培養(yǎng)時間勿過長,以免衛(wèi)星菌落的出現(xiàn)。很多因素都可以影響轉化的效率,特別需要注意的有兩點,一是制備感受態(tài)細胞時的OD值,二是所用試劑要分析純以上,并用雙蒸水或超純水(如Mili Q)配制。

【實驗安排】
實驗前兩天挑E. coli菌種在LB平板上劃線,37℃培養(yǎng)過夜。實驗前一天各組要將試劑準備好,包括培養(yǎng)基的消毒滅菌。下午臨下課時從平板上挑新鮮的單菌落接種到3mL液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜。轉化完畢,次日一早觀察記錄結果,并清理余下的菌種試劑等。

【實驗報告要求與思考題】
1.制備感受態(tài)細胞和轉化時,應特別注意哪些環(huán)節(jié)。
2.轉化效率的計算:轉化效率是指每微克質粒DNA轉化細胞產生的轉化子數(shù)目,請列表表示你的轉化結果并算出轉化率(列出計算公式)。你所做實驗的轉化效率(正對照)是多少? 如果過低(如低于104 cfu/μg DNA),請分析可能的原因。需要注意的是,連接產物的轉化效率是非常低的,為什么?
3.若實驗出現(xiàn)不正常的結果,請分析原因。

附錄:大腸桿菌的轉化方法
一、試劑
TB溶液:1.512g PIPES,1.1025g CaCl2,9.31875g KCl,溶于水,以5N KOH調pH6.7,再加入5.44225g MnCl2,定容至500ml,0.22?m 濾膜過濾滅菌,4℃保存。
SOB培養(yǎng)基:Tryptone 20g (OXOID公司);Yeast extract 5g (OXOID公司);NaCl 0.5g,加800ml雙蒸水,加入250mmol/L KCl溶液10ml,用10mol/L NaOH調pH至7.0,定容至1,000ml,高壓滅菌,4℃保存;使用前加入5ml經高壓滅菌的2mol/L MgCl2溶液。
SOC培養(yǎng)基:含20mmol/L葡萄糖的SOB培養(yǎng)基,SOB培養(yǎng)基高壓滅菌后,降溫至60℃或以下時,加入20ml經過濾除菌的1mmol/L葡萄糖溶液,4℃保存。
DMSO

二、方法
(一)感受態(tài)細胞的制備
1.將E.coli DH5α,涂布于LB (A-) 培養(yǎng)基上,37℃過夜。
2.挑取2-3個直徑2-3mm的大菌落,接種到50 ml SOB培養(yǎng)基中。在250 ml三角瓶中18℃,200-250rpm振蕩培養(yǎng),直到OD=0.6,約需要36-48hr。
3.將三角瓶冰浴10分鐘。
4.轉移菌液到50 ml離心管。2,500g,10min,4℃。
5.菌體用16 ml冰預冷的TB溶液懸浮,冰浴10 min。
6.2,500g,10min,4℃。
7.菌體用4ml冰預冷的TB溶液懸浮,加入280ul DMSO。
8.菌液于冰浴10分鐘后分裝到凍存管。每管200ul。液氮冷卻,保存于液氮中。大月0分鐘后,轉移到-40℃冰箱保存。

(二)轉化
1.將LB抗性平板,SOC培養(yǎng)基,于37℃預熱。
2.室溫溶解感受態(tài)細胞。
3.取200uL菌液加入1.5mL離心管中,放于冰中。
4.加入1-5uL質粒溶液,用槍頭混勻,冰浴30min。
5.42℃熱激30秒,冰浴。
6.加入800uL SOC培養(yǎng)基,37℃,250r/min,1hr。
7.涂布LB抗性平板,37℃過夜。

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