特異性的選擇主要需要考慮四個方面：蛋白特異性、種屬特異性、實驗方法特異性、標(biāo)記物的特異性。

1、蛋白特異性：

針對需要檢測的蛋白查找抗體，幾個細(xì)節(jié)要區(qū)分，重組表達(dá)的蛋白和內(nèi)源性蛋白的檢測，對抗體的要求是不一樣的，注意查看抗體說明書的檢測說明。如果重組蛋白不 是全長表達(dá)，則需要注意抗體的免疫原區(qū)域是否在重組蛋白區(qū)域內(nèi)。內(nèi)源性蛋白能清楚其剪切與修飾的方式，特殊表型的蛋白需要進(jìn)行序列比對，并結(jié)合抗體免 疫原序列，查看交叉反應(yīng)的情況。磷酸化蛋白檢測需要確定具體位點(diǎn)，不同位點(diǎn)的磷酸化意味著可能有不同的機(jī)制存在，不宜一概而論。

2、種屬特異性：

同種蛋白不同物種，有著或大或小的差異。目前大部分商品化抗體都是以人源蛋白序列為模板重組蛋白或設(shè)計多肽抗原的，根據(jù)蛋白的同源情況與其他種屬發(fā)生交叉 反應(yīng)。需要參照說明書注明的可反應(yīng)種屬信息。一些稀有種屬很難找到抗體，可以通過蛋白的序列比對，選擇同源序列免疫的抗體，不過一般這種情況生產(chǎn)商不會受 理其關(guān)于質(zhì)量的申訴，如果可以申請到免費(fèi)的抗體樣品，則利于抗體選擇。 

3、實驗方法特異性：

目前使用抗體的實驗方法有很多，不同的使用方法過程中，因為對蛋白樣品的處理方式不一樣，蛋白的含量有差異，對抗體的識別表位和效價要求都是不一樣的。具體 的根據(jù)說明書注明的產(chǎn)品應(yīng)用方法進(jìn)行選擇。但是生產(chǎn)商一般不會將每個抗體都進(jìn)行各種實驗的檢測，目前檢測比較多的只是WB、IHC、IF等，如果針對具體 的實驗方法沒有找到合適的抗體的，可以結(jié)合蛋白序列分析和抗體的抗原信息，選擇盡可能有效果的抗體。同樣，申請到免費(fèi)的抗體樣品是個很好的途徑。

4、標(biāo)記物的特異性

一般基于實驗操作的實驗方法不會使用帶有標(biāo)記的一抗，比如WB、IHC等，都是通過二抗類的試劑標(biāo)記達(dá)到結(jié)果呈現(xiàn)的目的。但是基于儀器分析的一些實驗，可能 就會使用到直接標(biāo)記的一抗，比如流式實驗。那么需要了解到自己將要使用的儀器能檢測到的熒光范圍，針對不通的參數(shù)要求選擇對應(yīng)的標(biāo)記物。在免疫熒光雙標(biāo)實 驗中，需要選配不同的熒光標(biāo)記物。