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上海信裕生物科技有限公司

預(yù)測小分子抗癌活性有了新算法

時間:2012-12-19閱讀:364
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 記者從中科院昆明動物研究所獲悉,該所李功華博士在研究員黃京飛的指導(dǎo)下,開發(fā)了一個新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對算法,并成功應(yīng)用于預(yù)測小分子的抗癌活性。近日,該研究發(fā)表在*計算生物學(xué)雜志《生物信息學(xué)》上。

 
據(jù)李功華介紹,開發(fā)新的抗癌藥物是科學(xué)界和醫(yī)學(xué)界的熱點和難點。直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物具有花費大、時間長的特點。以小分子為例,現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個,因此,直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此,建立一個、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計算生物學(xué)篩選系統(tǒng)對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。
 
為建立抗癌藥物活性的計算生物學(xué)預(yù)測系統(tǒng),李功華開發(fā)了一個新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對算法,通過交叉驗證發(fā)現(xiàn)其預(yù)測的線下面積達(dá)到了0.878,顯示該算法能很好地預(yù)測藥物小分子的抗癌活性。
 
同時,李功華還開發(fā)了一個簡便易用的預(yù)測抗癌藥物活性的網(wǎng)頁服務(wù)器,使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者所應(yīng)用。

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