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上海信裕生物科技有限公司

TALE 蛋白識(shí)別雙鏈 DNA 的分子機(jī)制

時(shí)間:2013-10-30閱讀:606
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PPR 蛋白的 RNA 結(jié)合模式與已知的 RNA 結(jié)合蛋白均不同。 PPR 蛋白由多個(gè) PPR 重復(fù)單元組成,大多數(shù)情況下,一個(gè)經(jīng)典的 PPR 重復(fù)單元含有35個(gè)氨基酸,每一個(gè)重復(fù)單元可以特異性地識(shí)別一個(gè) RNA 堿基,近兩年的生物信息學(xué)和初步生物化學(xué)研究研究顯示 PPR 模塊與 RNA 序列有特異的對(duì)應(yīng)關(guān)系,但其識(shí)別機(jī)理及識(shí)別密碼尚不明確。揭示 PPR 蛋白特異識(shí)別 RNA 堿基的分子機(jī)制對(duì)于理解 PPR 蛋白的工作機(jī)理以及促進(jìn) PPR 蛋白生物技術(shù)領(lǐng)域的應(yīng)用具有重要意義。{試劑酶聯(lián)網(wǎng):www.shjgogo.com}   ELISA試劑盒相關(guān)產(chǎn)品推薦:

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顏寧教授研究組與施一公、朱健康、王佳偉、王宏偉等課題組合作,選擇源自玉米葉綠體的 PPR10 蛋白進(jìn)行了深入的結(jié)構(gòu)生物學(xué)和生物化學(xué)分析,zui終獲得了 PPR10 蛋白在未結(jié)合 RNA 和特異結(jié)合靶標(biāo)PSAJ單鏈 RNA 兩種狀態(tài)下的高分辨率晶體結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)顯示, PPR10 包含19個(gè) PPR 重復(fù)單元,每個(gè) PPR 重復(fù)單元均為helix-loop-helix結(jié)構(gòu),多個(gè)重復(fù)單元組成兩圈右手超螺旋。 PPR10 -PSAJ的復(fù)合體晶體結(jié)構(gòu)則清晰地揭示了 PPR 蛋白特異性識(shí)別 RNA 堿基的分子機(jī)理。特異識(shí)別發(fā)生于 PPR 重復(fù)單元的第2、5、35位的氨基酸與相對(duì)應(yīng)的 RNA 堿基,這一結(jié)構(gòu)生物學(xué)發(fā)現(xiàn)為破解 PPR 的 RNA 識(shí)別密碼提供了直接的依據(jù)。

自然界中有許多具有重復(fù)單元構(gòu)造的蛋白質(zhì),其結(jié)構(gòu)與功能的揭示往往可以把這些蛋白質(zhì)改造為重要的工具蛋白。例如科學(xué)家根據(jù) TALE 蛋白對(duì) DNA 序列的特異識(shí)別,設(shè)計(jì)組裝能夠識(shí)別任意序列雙鏈 DNA 的 TALE N工具酶,進(jìn)而對(duì)基因組進(jìn)行改造。 TALE N已經(jīng)在多個(gè)物種中獲得了廣泛應(yīng)用。這是顏寧課題組與合作者繼 2012 年 1 月在《科學(xué)》報(bào)道 TALE 蛋白識(shí)別雙鏈 DNA 的分子機(jī)制后,對(duì)重復(fù)單元蛋白的又一項(xiàng)結(jié)構(gòu)與功能研究,希望可以促進(jìn) PPR 在生物技術(shù)中的應(yīng)用。

上海同步輻射光源(SSRF)何建華研究員及郁峰博士為數(shù)據(jù)收集提供了及時(shí)有效的幫助,保證了研究組在這一課題上取得突破。南開(kāi)大學(xué)龍加福研究組為 PPR 蛋白的生化性質(zhì)鑒定提供了重要支持。 

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