伴隨著經(jīng)濟社會的飛速發(fā)展，我國的生態(tài)環(huán)境形勢日益嚴(yán)峻。黨和國家對此高度重視，提出建設(shè)美麗中國的戰(zhàn)略任務(wù)，大力推動生態(tài)文明建設(shè)，并加快推進環(huán)境保護稅立法進程。為實現(xiàn)這一目標(biāo)，在環(huán)境保護稅立法過程中，應(yīng)著重處理好以下六對關(guān)系。
　　
　　處理好兩個體系之間的關(guān)系。環(huán)境稅的開征涉及環(huán)境管理體系和稅務(wù)征收管理體系。這兩個體系由不同部門負(fù)責(zé)實施，兩部門之間應(yīng)相互支持配合、協(xié)同共進。就征稅機構(gòu)而言，若向污染者征收環(huán)境稅，就必須首先了解污染者的生產(chǎn)運行情況，核定其耗費環(huán)境資源的具體數(shù)量。然而，由于征稅機構(gòu)與污染者之間存在信息不對稱的問題，且缺乏核實企業(yè)耗費環(huán)境資源情況的技術(shù)能力，故需要環(huán)保部門提供相關(guān)支持。與此同時，征稅部門通過征收環(huán)境稅，有助于遏制環(huán)境污染行為，促進環(huán)境質(zhì)量提升。
　　
　　處理好環(huán)境保護稅收入分配和使用之間的關(guān)系。首先，要處理好中央與地方收入分配的問題。我國開征環(huán)境稅主要通過費改稅的形式進行，排污費收取后主要用于地方治理環(huán)境污染、進行環(huán)境基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)，開征環(huán)境稅后，中央和地方收入分配的問題必須處理好。其次，要處理好環(huán)境保護稅使用的問題。發(fā)達國家的經(jīng)驗表明，如果將環(huán)境保護稅用于專門的環(huán)境基金，實現(xiàn)專款，公眾就會支持這一稅收，否則就會引起質(zhì)疑。鑒于此，發(fā)達國家普遍建立了環(huán)境稅專款制度，如法國將95%的環(huán)境保護稅收入交由國家或跨地區(qū)的機構(gòu)進行專款。我國可借鑒執(zhí)行?？钪贫?，將稅收專門用來治理污染，建設(shè)環(huán)境保護設(shè)施，加強環(huán)境管理，以充分發(fā)揮環(huán)境稅的作用。
　　
　　處理好公平與效率之間的關(guān)系。環(huán)境稅收制度要體現(xiàn)公平。在資源環(huán)境的開發(fā)、利用和保護上，所有主體一律平等，享有同等的權(quán)利，承擔(dān)同等的義務(wù)，因此，也應(yīng)對自己所耗費環(huán)境資源負(fù)擔(dān)相應(yīng)的成本代價。與此同時，要注重效率原則。向納稅人征收環(huán)境保護稅，會增加其成本，因此，確定合理的成本、使納稅人合理負(fù)稅就顯得尤為重要。若強制污染企業(yè)承擔(dān)過重的污染責(zé)任，可能會使企業(yè)面臨破產(chǎn)，顯然不利于經(jīng)濟的可持續(xù)發(fā)展。因此，在設(shè)計環(huán)境稅稅率時，應(yīng)保持總體稅收的平衡和穩(wěn)定，使納稅人不會因為繳稅而不堪重負(fù)。
　　
　　處理好之間的協(xié)作關(guān)系。當(dāng)前，化深刻影響著每一個國家的利益。在這種背景下，征收環(huán)境保護稅不能僅考慮本國國內(nèi)的情況，還要綜合考慮因素的影響和制約。由于環(huán)境稅改變了相對價格，提高了企業(yè)成本，如果這一成本價格信號無法傳遞給用戶，且稅負(fù)轉(zhuǎn)嫁難以實現(xiàn)，就削弱了本國企業(yè)的競爭力。因此，應(yīng)高度關(guān)注環(huán)境稅對本國企業(yè)參與競爭產(chǎn)生的副作用，加強同其他國家協(xié)作，力爭做到協(xié)同行動，努力為本國企業(yè)創(chuàng)制適應(yīng)化的條件，切實保護本國企業(yè)的競爭力。
　　
　　處理好環(huán)境稅收制度與經(jīng)濟發(fā)展的關(guān)系。開征環(huán)境保護稅會深刻影響一個國家的經(jīng)濟發(fā)展。上一些學(xué)者對環(huán)境稅如何影響經(jīng)濟發(fā)展進行了研究。有研究認(rèn)為，開征環(huán)境稅對經(jīng)濟發(fā)展起到副作用，并質(zhì)疑弱式雙重紅利的存在；但也有研究認(rèn)為，開征環(huán)境稅對經(jīng)濟發(fā)展產(chǎn)生正效果，如MillockandNauges通過對法國空氣污染稅的經(jīng)濟影響的研究，認(rèn)為環(huán)境稅開征對經(jīng)濟增長有著顯著的正影響。鑒于此，我國環(huán)境稅的開征應(yīng)與我國整體發(fā)展發(fā)展水平相適應(yīng)，避免對經(jīng)濟發(fā)展產(chǎn)生副作用。應(yīng)堅持合理適度的原則，以既能限制污染，又能促進生產(chǎn)方式轉(zhuǎn)變?yōu)榍疤?，建立適合我國國情的環(huán)境稅收制度。
　　
　　處理好環(huán)境稅與其他環(huán)境保護手段的關(guān)系。開征環(huán)境稅并不是解決環(huán)境問題的藥方，它具有局限性，在有些環(huán)節(jié)或領(lǐng)域，它的作用可能會受到限制。在國外，為克服這一弊端，就將能源開發(fā)利用與環(huán)境保護相協(xié)調(diào)，注重將傳統(tǒng)的行政手段同市場手段結(jié)合起來。因此，要將開征環(huán)境稅與其他環(huán)境保護手段緊密結(jié)合起來，使之互為補充、協(xié)同共進。