一種非熒光發(fā)色團(tuán)BHQ-3 NHS，871240-94-7

【資料簡(jiǎn)介】

英文名稱：BHQ-3 NHS

CAS：871240-94-7

外觀：深紫色粉末

分子式：C37H38N7O4+

分子量：644.76

儲(chǔ)存條件：-20°C，避光避濕

結(jié)構(gòu)式：

產(chǎn)品簡(jiǎn)介：黑暗猝滅劑?-3染料寡核苷酸修飾。BHQ-3可以位于5或3末端或寡核苷酸的內(nèi)部。BHQ?-3標(biāo)記的寡核苷酸用于許多應(yīng)用，包括用于實(shí)時(shí)PCR的雙標(biāo)記熒光探針。該暗猝滅劑具有620-730 nm的強(qiáng)吸收范圍，可對(duì)在該范圍內(nèi)發(fā)出熒光的熒光團(tuán)（如Quasar?670和Quasar 705染料）進(jìn)行猝滅。

NHS修飾是合成后與一個(gè)伯氨基的共軛，因此是一個(gè)附加的需要用氨基修飾。C6或C12氨基可置于5&＃39;或?qū)τ?&＃39;端，使用C3或C7氨基，對(duì)于內(nèi)部位置，使用氨基修飾的堿，例如氨基dT C6?；贜HS的產(chǎn)率修飾是使用伯氨基進(jìn)行的合成后共軛。與可作為酰胺的直接自動(dòng)化偶聯(lián)改性相比，產(chǎn)率較低。近似各種規(guī)模的產(chǎn)量如下所示。

50 nmol規(guī)模合成的***終產(chǎn)量約為2 nmol。

200 nmol規(guī)模合成的~5 nmol***終產(chǎn)量。

1μmol規(guī)模合成的~16 nmol***終收率

黑洞猝滅劑-1（BHQ-1）被歸類為暗猝滅劑（一種非熒光發(fā)色團(tuán)），被***使用作為各種熒光共振能量轉(zhuǎn)移（FRET）DNA檢測(cè)探針中的3&＃39;-猝滅部分。這樣的探針主要用于***分析，但也可用于***結(jié)構(gòu)研究（1）。例子包括TaqMan探針（2）、蝎子引物（3）和分子信標(biāo)（4）。BHQ-1的吸光度為534 nm，有效吸光度范圍為480-580 nm。這是用于與熒光染料配對(duì)的猝滅劑，熒光染料在可見光范圍（519-556 nm）的黃綠色到黃色部分發(fā)射。這個(gè)染料的發(fā)射光譜與BHQ-1的吸收光譜充分重疊，從而使后者能夠淬滅染料前者熒光***。

在FRET探針中使用暗猝滅器的優(yōu)點(diǎn)是低背景熒光（因此更好）信噪比，（b）更高的動(dòng)態(tài)范圍，（c）適用于多重分析（由于暗猝滅器沒(méi)有二次熒光），以及（d）使用暗猝滅劑易于合成FRET探針（因?yàn)榘碘鐒┰诘途畚锩摫Ｗo(hù)步驟中抗降解）（5）。

作為***雜交探針檢測(cè)系統(tǒng)使用的各種熒光染料和猝滅劑分子的開發(fā)允許開發(fā)幾種不同的實(shí)時(shí)PCR分析系統(tǒng)，這些系統(tǒng)利用染料猝滅劑雜交探針，僅當(dāng)它們與目標(biāo)結(jié)合時(shí)才產(chǎn)生熒光信號(hào)。然而，為了正確設(shè)計(jì)針對(duì)特定目標(biāo)的分析，重要的是根據(jù)分析中使用的雜交探針類型、待檢測(cè)的目標(biāo)數(shù)量以及可用于執(zhí)行分析的設(shè)備類型，仔細(xì)選擇雜交探針的染料和猝滅劑。

1） 選擇能被激發(fā)源和你計(jì)劃在實(shí)驗(yàn)中使用的分光光度熱循環(huán)儀的光學(xué)元件適當(dāng)激發(fā)和檢測(cè)的熒光染料?；诩す獾募ぐl(fā)源通常在窄波長(zhǎng)范圍內(nèi)（例如，氬離子激光器為500-540 nm）提供激發(fā)，而白光源（例如，鹵鎢燈）和發(fā)光二極管與激發(fā)和發(fā)射濾光片結(jié)合可在整個(gè)可見范圍（400-700 nm）內(nèi)激發(fā)熒光團(tuán)。

2） 對(duì)于用一個(gè)雜交探針檢測(cè)一個(gè)目標(biāo)，建議對(duì)染料使用FAM、HEX或TET，因?yàn)樗鼈兛梢栽谒蟹止夤舛葻嵫h(huán)儀上檢測(cè)到，并且所有三種探針都可以使用磷酰胺（這使得探針的合成簡(jiǎn)單且具有***效益）。

3） 對(duì)于復(fù)合分析，至少需要兩種不同的雜交探針，應(yīng)選擇吸收和發(fā)射波長(zhǎng)分離良好的染料。

4） 對(duì)于FRET雜交探針，應(yīng)選擇光譜高度重疊的熒光染料猝滅劑對(duì)。請(qǐng)參閱淬火劑選擇表以選擇適當(dāng)?shù)拇慊饎?br/>

5） 對(duì)于基于接觸猝滅的雜交探針（例如，分子信標(biāo)），任何非熒光猝滅劑都應(yīng)工作良好。

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其他產(chǎn)品列表：

BHQ-1 acid      1190431-95-8

BHQ-2 acid      1214891-99-2

BHQ-3 acid      1338332-66-3

BHQ-1 amine     1308657-79-5

BHQ-2 amine     1241962-11-7

BHQ-3 amine     1661064-89-6

BHQ-1 NHS       916753-61-2

BHQ-3 NHS       871240-94-7