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江蘇綠葉生物科技有限公司

在三維水平研究細(xì)胞的新工具

時間:2014-12-5閱讀:253
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開發(fā)了一種軟件,研究人員利用這種軟件,能夠比以往更詳細(xì)地研究病毒、細(xì)菌和人體組件。

檢驗cellPACK

cellPACK軟件解決了結(jié)構(gòu)生物學(xué)的一個主要問題。雖然科學(xué)家們已經(jīng)開發(fā)出了一些技術(shù),來研究相對較大的結(jié)構(gòu)(例如細(xì)胞)和非常小的結(jié)構(gòu)(例如蛋白質(zhì)),但它一直難以在中等的“中尺度”范圍內(nèi)可視化這些結(jié)構(gòu)。

上海隆壘研究人員可以迅速有效地處理他們所收集的較小結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù),并在這種中等尺度范圍內(nèi)裝配模型。以前,研究人員必須手工創(chuàng)建這些模型,這需要數(shù)周或數(shù)月的時間,而使用cellPACK則只需要幾小時。

作為該軟件能力的一個示范,這項新研究的作者創(chuàng)建了一種HIV模型,展示了外部“刺突(spike)”蛋白在不成熟病毒表面是如何分布的。

這種新模型檢驗了HIV研究人員通過超分辨率顯微鏡研究得出的一個結(jié)論:spike蛋白在不成熟病毒表面是隨機分布的。但是,通過使用cellPACK生成數(shù)千個模型,檢驗替代假設(shè).一個團隊的努力

上海隆壘研究員繼續(xù)從事這個項目。一種容易的方法來可視化中尺度結(jié)構(gòu)。cellPACKJohnsonautoPACK軟件的一個擴展,這個軟件可標(biāo)出材料的密度,從一個建筑物的混凝土到動脈中的紅血細(xì)胞。

隨著cellPACK的產(chǎn)生,成功解決了將不同來源和多尺度數(shù)據(jù)整合到虛擬模型(可以模擬細(xì)胞內(nèi)生物相關(guān)的分子相互作用)的挑戰(zhàn)。這種用戶界面友好的工具,為以實驗室之間合作的方式進行數(shù)據(jù)分析和模擬,提供了一種新的平臺。

研究人員將改進這種軟件,使其能模擬新的形狀。 使其成為開放資源,會使這種工具更為強大?,F(xiàn)在軟件是可用的,而且非常有用,具有具有完善的實驗技術(shù)開發(fā)平臺,成熟的抗原、抗體研發(fā)系統(tǒng),熟練掌握各種酶聯(lián)技術(shù),結(jié)合公司的研發(fā)團隊,可以有效的保證公司產(chǎn)品強的穩(wěn)定性和高的準(zhǔn)確性,同時又具有zui有競爭力的價格。

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