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南京信帆生物技術(shù)有限公司
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南京信帆生物:蛋白質(zhì)序列分析和結(jié)構(gòu)預測

時間:2016/4/27閱讀:1060
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【實驗目的】 
1、掌握蛋白質(zhì)序列檢索的操作方法; 
2、熟悉蛋白質(zhì)基本性質(zhì)分析; 
3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白質(zhì)功能預測,了解基于motif、 結(jié)構(gòu)位點、結(jié)構(gòu)功能域數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)功能預測; 
4、了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測。 
【實驗內(nèi)容】 
1、使用Entrez或SRS信息查詢系統(tǒng)檢索人脂聯(lián)素 (ADIponectin)蛋白質(zhì)序列; 
2、使用BioEdit軟件對上述蛋白質(zhì)序列進行分子質(zhì)量、氨基酸組成、和疏水性等基本性質(zhì)分析; 
3、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行基于ncbi/Blast軟件的蛋白質(zhì)同源性分析; 
4、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行motif結(jié)構(gòu)分析; 
5、對人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列進行二級結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)預測。 
【實驗方法】 
1、人脂聯(lián)素蛋白質(zhì)序列的檢索: 
(1)調(diào)用Internet瀏覽器并在其地址欄輸入Entrez; 
(2)在Search后的選擇欄中選擇protein; 
(3)在輸入欄輸入homo sapiens adiponectin; 
(4)點擊go后顯示序列接受號及序列名稱; 
(5)點擊序列接受號NP_004788 (adiponectin precursor; adipose most abundant gene transcript 1

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