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該項(xiàng)研究對(duì)6個(gè)中國(guó)重要玉米雜交組合骨干親本進(jìn)行全基因組重測(cè)序，利用SOAP軟件v2.18比對(duì)獲得的12.6億75bp的雙末端片段與玉米的參考基因組序列，發(fā)現(xiàn)了100多萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（SNPs）和3萬(wàn)多個(gè)插入缺失多態(tài)性位點(diǎn)（IDPs），建立了高密度的分子標(biāo)記的基因圖譜。同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn)了101個(gè)低序列多態(tài)性區(qū)段，在這些區(qū)段中含有大量在選擇過(guò)程中與玉米性狀改良有關(guān)的候選基因。
此外，通過(guò)將玉米自交系Mo17及其他自交系的基因序列與玉米自交系B73的基因序列比對(duì)，研究人員對(duì)玉米自交系中基因丟失與獲得的多態(tài)性進(jìn)行了研究，發(fā)現(xiàn)在不同的自交系中存在不同數(shù)量的基因丟失與獲得性變異；利用SAOPdenovo軟件對(duì)在其它自交系中存在而在B73中缺失的序列進(jìn)行組裝，研究人員發(fā)現(xiàn)了很多目前公布的B73參考基因組序列中丟失的基因。這些發(fā)現(xiàn)不僅為高產(chǎn)雜交玉米育種骨干親本的培育提高了重要的多態(tài)性標(biāo)記，同時(shí)也補(bǔ)充了玉米基因數(shù)據(jù)集，為進(jìn)一步挖掘玉米基因組和遺傳資源提供了大量數(shù)據(jù)。
玉米具有非常顯著的雜交優(yōu)勢(shì)，利用該優(yōu)勢(shì)是提高產(chǎn)量主要的手段之一。在該報(bào)道中，研究人員選擇了中國(guó)歷*和目前廣泛流行的高產(chǎn)雜交組合骨干親本，并且根據(jù)多態(tài)性追蹤了這些骨干親本育成過(guò)程中基因組的變化方式。報(bào)道指出，目前的育種對(duì)遺傳資源的組合利用還是有限的，玉米的育種還存在著巨大的潛力。除此之外，該報(bào)道還發(fā)現(xiàn)這些骨干親本組合基因組的組合可以彌補(bǔ)另一方功能元件的缺失，這種基因丟失與獲得的多態(tài)變化和其他無(wú)義突變的互補(bǔ)作用可能與雜種優(yōu)勢(shì)有關(guān)。
華大基因研究院的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人徐訊說(shuō)：“隨著測(cè)序成本的降低和已知基因組序列的物種增多，重測(cè)序已經(jīng)成為動(dòng)植物育種研究中zui為迅速而有效的方法之一，可在全基因組水平上掃描并檢測(cè)與玉米重要性狀相關(guān)的突變位點(diǎn)。玉米基因組數(shù)據(jù)資源的不斷擴(kuò)充將對(duì)玉米基因組學(xué)研究和應(yīng)用有著巨大的推動(dòng)作用。”
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