由于鑄膠溶液非常重要且多樣，因此下面把所有電泳溶液的配置方法仔細(xì)列出，希望能在每一個(gè)實(shí)驗(yàn)室成功進(jìn)行電泳；但使用者一定要明白其配制的原理與各種濃度的算法，而不是只會(huì)依配方泡制而已。
A液：丙烯酰胺液 （total 30%, cross-linking 2.6%）
丙烯酰胺 （acrylamide, Merck 10784） 29.2 gm
Bis 架橋劑 （Sigma M-7256） 0.8 gm
加純水溶解至 100 mL A 液也有商品已經(jīng)配制好溶液者，若實(shí)驗(yàn)課采用Ameresco 的40%溶液（T40%, C2.6%），配法有些變動(dòng)，請(qǐng)?zhí)貏e注意；Bis 是N’,N’-methylene-bis（acrylamide） 的簡(jiǎn)稱，可看成是兩分子acrylamide連在一起，作為架橋物，以便成為立體的膠體； 以30℃加熱助溶，有不溶物質(zhì)須過(guò)濾去除；若丙烯酰胺品質(zhì)不佳或久貯，在溶成100 mL 后，可加一些離子交換樹(shù)脂Dowex MR-3 攪拌，放過(guò)夜并過(guò)濾后置4℃保存； 注意acrylamide 溶液有神經(jīng)毒性！ 不要直接接觸，凝膠后毒性消失，但膠體無(wú)法達(dá)到百分的百凝膠，因此也要小心處理膠片。
B液：分離膠體緩沖液 （running或separation buffer）
Tris （Tris base, 1.5 M） 90.8 gm
TEMED （Sigma T-8133） 1.8 mL
溶入300 mL 水，以l M HCl 119 mL 調(diào)pH 到8.8 再加水至500 mL TEMED （tetramethylenediamine） 可幫助自由基傳導(dǎo)，是催化劑。
C液：焦集膠體緩沖液 （stacking buffer）
Tris （Tris base, 0.5 M） 6.0 gm
TEMED （Sigma T-8133） 0.4 mL
溶入40 mL 水，加l M HCl 47 mL 調(diào)pH 至6.8，加水至 100 mL
D液：電泳緩沖液 （chamber buffer），5×溶液
Tris （Tris base, 0.05 M×5） 30.3 gm
甘胺酸 （glycine, 0.38 M×5） 142.6 gm
溶入800 mL 水，pH 調(diào)到8.3 后再加水至1 L 使用時(shí)稀釋5 倍 甘胺酸是電泳緩沖液的主要分子，是造成電泳樣本焦集的原因；近來(lái)多改用boric acid （下面F 液），應(yīng)自行試用何者為佳。
E 液：SDS-PAGE 樣品溶液，2×溶液
Tris （Tris base, 125 mM×2） 3.0 gm
80 Methods in Biotechnology Vol 1
EDTA·2Na （2 mM×2） 14.8 mg
SDS （2%×2） 4.0 gm
β-mercaptoethanol （5%×2, Sigma M-6250） 10.0 mL
加水80 mL 溶的，pH 調(diào)到6.8，再加水至 100 mL
F 液：通用電泳緩沖液，5×溶液
Tris （Tris base, 90 mM×5） 54.5 gm
Boric acid （80 mM×5） 24.8 gm
EDTA·2Na （2.5 mM×5） 4.7 gm
加水800 mL 溶的，pH 調(diào)到8.4，再加水至 1,000 mL 使用時(shí)稀釋5 倍。本溶液在disc-或SDS-PAGE 均通用，后者要加SDS 至0.1%。
SDS水溶液 （10%） SDS 粉末很輕，揚(yáng)起來(lái)很容易吸入肺部，在肺泡溶解產(chǎn)生界面活性的作用，使得肺部細(xì)胞無(wú)法進(jìn)行氧分子交換，非常危險(xiǎn)。
APS溶液 （過(guò)硫酸銨, 5%） :
APS （ammonium persulfate, Bio-Rad 161-0700） 50 mg溶于l mL 水中，使用前才配制好，隔日不可再用。 APS是自由基 （free radical） 的產(chǎn)生者，可誘發(fā)acrylamide的連鎖聚合反應(yīng)，因此是整個(gè)凝膠反應(yīng)的起始者。冬天可增至10%，夏天可減至2%。注意APS 固體很容易分解，應(yīng)密蓋貯于干燥皿；鑄膠無(wú)法凝結(jié)的毛病，多出自APS 的質(zhì)量不良。
追蹤染料 （tracking dye） :
Bromophenol blue （Sigma B-6896） l mg溶于5 mL 水，再加5 mL 甘油均勻混合。 加在樣本蛋白質(zhì)中，可增加樣本密度并賦予顏色，方便目視以注入膠片的樣本槽。
染色液 （CBR染液） :
Coomassie brilliant blue R-250 （CBR, Sigma B-0149） 1 gm溶于250 mL 水后，再加入250 mL 甲醇及50 mL 醋酸混合均勻，充分溶解CBR，若有不溶物質(zhì)，則須過(guò)濾后裝瓶密蓋。 Coomassie blue 有許多種不同的相關(guān)化合物，不要取用作為蛋白質(zhì)定量用的Coomassie blue G-250 來(lái)染色，效果稍差。
脫色液 （20%甲醇及10%醋酸）：
在一1 L 量筒中，先到入200 mL 甲醇及100 mL 醋酸，再加水至1 L，混合均勻后密蓋備用。 甲醇濃度可提高到30%，則可增加脫色速度，但小心脫色過(guò)度。
標(biāo)準(zhǔn)分子量組合︰
Pharmacia 有高低兩種分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)組合，SDS-PAGE 使用：
高分子量組： Thyroglobulin （669kD, 330 kD）, ferritin （440 kD, 220 kD, 18.5 kD）,catalase （232 kD, 36 kD）, albumin （67 kD）
低分子量組： Phosphorylase （94 kD）, albumin （67 kD）, ovalbumin （43 kD）, carbonic anhydrase （30 kD）, trypsin inhibitor （20 kD）, lactalbumin （14.4 kD）
另外Novel 有預(yù)先染好藍(lán)色的SeeBlue （LC5625） 標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)組合，除了一般電泳外，更可用在轉(zhuǎn)印，檢查轉(zhuǎn)印是否成功：
SeeBlue: Myosin （250 kD）, albumin （98 kD）, glutamic dehydrogenase （64 kD）,
alcohol dehydrogenase （50 kD）, carbonic anhydrase （36 kD）, myoglobin （30 kD）,
lysozyme （16 kD）, aprotinin （6 kD）, insulin B chain （4 kD