厭氧堆肥是在缺氧條件下，將垃圾中的可降解有機(jī)物通過厭氧微生物的代謝，使其達(dá)到腐熟,其產(chǎn)物除CO₂和水之外，還有氨、硫化氫、甲烷和其他有機(jī)酸等還原物質(zhì)。

厭氧堆肥可大概分為以下兩個階段：

一、產(chǎn)酸階段

產(chǎn)酸階段又可分為水解階段和酸化階段。在水解階段,厭氧菌根據(jù)所分解的對象可以分為纖維素分解菌、脂肪分解菌和蛋白質(zhì)分解菌，它們分別把多糖水解成單糖、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化成肽和氨基酸、脂肪轉(zhuǎn)化成甘油和脂肪酸。在酸化階段，由產(chǎn)醋酸細(xì)菌(例如膠醋酸菌和某些梭狀芽孢杄菌等)把較高級的脂肪酸分解成醋酸和氫；水解階段,分解脂眆時產(chǎn)生的長鏈脂肪酸如硬脂酸，消化蛋白質(zhì)時產(chǎn)生的芳族酸如苯基醋酸和吲哚酸，也被酸化階段細(xì)菌分解為醋酸和氫。

二、產(chǎn)甲烷階段

在產(chǎn)甲烷階段，甲烷菌把產(chǎn)酸階段產(chǎn)生的醋酸轉(zhuǎn)化為CH₄和CO₂，或者利用H₂把CO₂還原成甲烷，或者利用其他細(xì)菌產(chǎn)生的甲酸形成甲烷。在這一過程中，不同的物質(zhì)經(jīng)過不同的代謝過程，因而有不同的代謝速度。例如乙酸(醋酸)、甲酸可直接轉(zhuǎn)化為甲烷，代謝只要甲烷菌參與即可，轉(zhuǎn)化較快；但較復(fù)雜的有機(jī)物如葡萄糖的代謝則需要兩類微生物參與，速度要慢得多。

好氧堆肥與厭氧堆肥的相同點(diǎn)：

a.都是微生物作用下的有機(jī)物降解過程，需要微生物培養(yǎng)的條件，包括營養(yǎng)元素合理分配、溫度、pH值等；

b.降解有機(jī)污染物，殺滅病原體，提高N、P的比例，使生肥變成植物更易于吸收的熟肥。

好氧堆肥與厭氧堆肥的區(qū)別：

a.條件不同，好氧堆肥是在有氧條件下進(jìn)行，而厭氧堆肥是在厭氧條件下進(jìn)行的；

b.菌種不同，好氧堆肥是好氧菌起主導(dǎo)作用，而厭氧堆肥是厭氧菌起主導(dǎo)作用；

c.產(chǎn)物不同，好氧堆肥的產(chǎn)物是CO₂、H₂O，降解終產(chǎn)物沒有二次污染，而厭氧堆肥的產(chǎn)物是CH₄、H₂O等,CH₄是溫室氣體，處理不當(dāng)易造成二次污染；

d.降解能力不同，好氧堆肥可降解的有機(jī)物種類比較有限，而厭氧堆肥的能力較強(qiáng)，可以降解一些好氧情況下難降解的有機(jī)物。