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Equi-phi29 DNA Polymerase

參  考  價:1170 - 6240
具體成交價以合同協(xié)議為準
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    其他品牌

  • 廠商性質(zhì)

    生產(chǎn)商

  • 所在地

    上海市

規(guī)格

1000U 1170元 15盒可售

10KU 6240元 15盒可售

更新時間:2024-05-21 14:26:54瀏覽次數(shù):204次

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貨號 XG-P3000 規(guī)格 1000U、10KU
包裝 盒裝 用途 僅供科研研究實驗
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Equi-phi29 DNA Polymerase

Equi-phi29 DNA Polymerase

貨號

規(guī)格

分類

XG-P3000

1000U

其他DNA/RNA聚合酶

XG-P3000

10KU

其他DNA/RNA聚合酶

描述:Equi-phi29 DNA Polymerase 是 phi29 的改造體,并 經(jīng)多次純化分離而得。在保留了 phi29 DNA 聚合酶的鏈置 換、連續(xù)合成特性(>70kb)的基礎(chǔ)上,提高了滾環(huán)擴增的 反應(yīng)溫度,該酶酶可以在 42 度條件下持續(xù)的進行 DNA 合成 (而 phi29 DNA 聚合酶在此溫度下反應(yīng)活性很低)。 這種高溫的反應(yīng)特性,在以下幾個方面對實驗有明顯的 提升:(1)在 NGS 測序中,其提升了高 GC 含量、回文結(jié) 構(gòu)等復(fù)雜模板的延伸能力,使得 NGS 的覆蓋度更均一,降 低測序所需深度;(2)高溫的反應(yīng)條件,提升了基因組 DNA 的 WGA 產(chǎn)物的合成量,并可以進行變溫擴增;(3)降低測 序中 Gap 區(qū)域,提升單細胞測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和完整度;(4) 降低非特異性擴增產(chǎn)物;(5)提升 MDA/RCA 等實驗的擴增 性能和特異性。 除此外,該酶仍然具有很強的 3’→5’外切酶校讀功能, 合成的 DNA 片段保真性高。該酶的外切酶活性較強,因此 合成過程中引物需要 3’端硫代修飾,以降低外切活性對引物 的切割效應(yīng)。

儲存:-20℃可保存 3 年。
使用方法
1. 配制引物模板退火體系
10×phi29 Buffer 2 μl
dNTP Mixture (10 mM each) 1.2 μl
Template DNA 0.1-40 ng
硫代修飾的Oligo x μl
ddH2O Upto 19 μl
注意:在不同的實驗類型中,Oligo根據(jù)實驗需要自行選擇。
2. 引物和模板退火:體系配制完畢后,放置到 PCR 儀中,95℃ 3min,25℃ 3min。
3. 退火完畢后,向退火產(chǎn)物中加入 1μl Equi-phi29 DNAPolymerase,混合均勻。
4. 擴增反應(yīng)
4.1 恒溫擴增
對于環(huán)狀DNA模板采用恒溫反應(yīng)作為推薦使用30℃恒溫擴增,30℃孵育 6~16h.該酶在 30-42℃條件下均可工作,必要時根據(jù)實驗類型進行調(diào)整。
4.2 變溫擴增
對于基因組 DNA 或 cDNA 模板,推薦使用變溫擴增反應(yīng),以在短時間內(nèi)獲得更高產(chǎn)量,并提高了低濃度模板的擴增產(chǎn)量。在 PCR 儀上做如下設(shè)置:
【30℃ 5min;42℃ 15s】循環(huán) 72 次(約 6h)或 120次(約 10h).必要時,反應(yīng)結(jié)束后,可于 65°C 10min 進行失活反應(yīng)。
使用注意事項
(1)必要時可單獨額外添加終濃度 1 mM DTT 和 0.2mg/ml BSA,可提高反應(yīng)效率。
(2)該酶的反應(yīng)溫度為 42 ℃ (在 30~42℃之間均有活性)。
(3)65℃ 10min 即可使該酶失活。
(4)根據(jù)實驗類型需要,調(diào)整dNTP的濃度100~500 μM。
(5)添加 Yeast Pyrophosphatase可提高 DNA 產(chǎn)量。
(6)反應(yīng)引物 3’端的硫代修飾可避免引物降解。



Equi-phi29 DNA Polymerase



Equi-phi29 DNA Polymerase

一、模板DNA:PCR反應(yīng)需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;

二、引物:PCR反應(yīng)的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;

三、dNTPs:PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成         等生物學(xué)過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;

四、Taq DNA聚合酶:PCR反應(yīng)需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;

五、PCR buffer溶液:對PCR反應(yīng)具有緩沖作用,調(diào)節(jié)反應(yīng)pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應(yīng)特異性,從而提高反應(yīng)效率;

六、酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。

七、MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。

八、DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物;


Equi-phi29 DNA Polymerase



Equi-phi29 DNA Polymerase

①Oligo dT
選擇Oligo dT時,要求RNA必須有Poly A,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,對RNA樣品的質(zhì)量要求較高,不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應(yīng),建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。
②隨機引物
適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,鏈cDNA合成反應(yīng)中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應(yīng)時設(shè)計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關(guān)系,一般建議每5µg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5µg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導(dǎo)致小片段產(chǎn)物(<500bp)的增加和長片段、全長產(chǎn)物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物(GSP)是某個基因序列的一部分,與模板互補的引物。該引物需要結(jié)合目標RNA的已知序列進行設(shè)計。由于引物和RNA序列特異性結(jié)合,每個目標RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此,當分析多種目標時,則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物,建議對退火溫度進行優(yōu)化。

Equi-phi29 DNA Polymerase

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