據了解，蝙蝠是夜行性動物。食蟲蝙蝠主要用回聲定位來確定方位、捕捉昆蟲，其眼睛退化；而生活在熱帶地區(qū)的舊大陸果蝠沒有回聲定位能力，它們主要依賴視覺和嗅覺來尋找食物，其眼睛很發(fā)達。
 
該所副研究員沈永義告訴《中國科學報》記者，此前，他在中科院院士張亞平的指導下，克隆了視網膜上視桿細胞中控制感光的視紫紅質的RHO基因，發(fā)現無論是眼睛退化的食蟲蝙蝠還是眼睛發(fā)達的舊大陸果蝠的視桿細胞都有表達RHO基因。這說明即使是那些眼睛高度退化的食蟲蝙蝠，仍然具有暗視覺。而且，該基因在果蝠與墓蝠（食蟲蝙蝠，眼睛沒退化）間發(fā)生了趨同進化，長翼蝠和菊頭蝠（眼睛都退化）也發(fā)生了趨同進化。
 
該結果揭示了在蝙蝠分化后，可能由于對暗視覺的趨同需求（有些種類趨向于更多地依賴視覺，眼睛發(fā)達；而有些趨向于較少依賴視覺，眼睛退化），導致了RHO基因在蝙蝠里面發(fā)生了多次趨同進化。
 
考慮到RHO只是暗視覺通路里面的一個基因，而暗視覺需要多個基因起作用，因此，沈永義等又研究了暗視覺通路上游的CRX基因和下游的SAG基因。結果發(fā)現，這兩個基因也在墓蝠和果蝠中發(fā)生了趨同進化。
 
沈永義告訴《中國科學報》，有意思的是，在對蝙蝠回聲定位的研究上，他們也發(fā)現這種復雜功能的趨同進化是多基因作用的結果。“這些研究表明，復雜的性狀是由多基因聯合控制的結果，這對進一步研究復雜性狀的起源和進化具有重要意義。”