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更新時(shí)間：2022-10-29 15:13:21瀏覽次數(shù)：4352次
聯(lián)系我時(shí)，請告知來自 環(huán)保在線奧林巴斯顯微鏡圖像處理軟件cellSens
奧林巴斯cellSens平臺根據(jù)操作者偏好的工作流程，創(chuàng)造了一種的個(gè)性化和直觀的成像體驗(yàn)。在使用cellSens時(shí)，可以通過顯示畫面和放置的圖標(biāo)、工具欄來實(shí)現(xiàn)的控制，從而簡化桌面，增強(qiáng)效率。
cellSens便于使用，功能強(qiáng)大且靈活。軟件使用了模塊設(shè)計(jì)，可以根據(jù)預(yù)算，及成像應(yīng)用進(jìn)行選配。這就使該軟件能夠不斷發(fā)展并滿足研究的需求。
cellSens軟件包
cellSens Entry
cellSens Entry是初次進(jìn)行數(shù)字圖像采集和文件記錄的研究人員的理想選擇。奧林巴斯的cellSens Entry通過的定制化界面對相機(jī)進(jìn)行控制，確保了每一位用戶都可以使用自己的設(shè)置采集到想要的圖像。
cellSens Standard
奧林巴斯cellSens Standard是基于cellSens Entry的升級軟件包，圖像采集不限于單一圖像，同時(shí)具有高級圖像采集處理能力(比如延時(shí)處理)，并可以控制電動(dòng)和編碼顯微鏡組件。測量功能也得到擴(kuò)展，具有多種形態(tài)參數(shù)，以及交互功能且不會(huì)影響已測量過的圖像即可自由編輯測量目標(biāo)：僅需要單擊即可將所有結(jié)果導(dǎo)出到Microsoft Excel。cellSens Standard采用了可以增加更多的“Solutions"以增加更多的功能，因此具有可擴(kuò)展性。全景成像和景深擴(kuò)展使顯微鏡不再受到其光學(xué)成像的限制，而NetCam功能使該設(shè)備能夠方便而自由地通過局域網(wǎng)或互聯(lián)網(wǎng)投射實(shí)時(shí)圖像，用于協(xié)作和教學(xué)目的。
cellSens Dimension
奧林巴斯cellSens系列產(chǎn)品中的成員是cellSens Dimension，它具有一種而突出的性能，即新的圖形化實(shí)驗(yàn)管理系統(tǒng)。不用花費(fèi)時(shí)間培訓(xùn)，初學(xué)者僅需點(diǎn)擊幾次鼠標(biāo)，“制定"出實(shí)驗(yàn)計(jì)劃，即可完成對復(fù)雜研究的成像以及穩(wěn)定的控制。以自動(dòng)循環(huán)、用戶交互和的硬件控制來完成復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)，并從一次實(shí)驗(yàn)中自動(dòng)產(chǎn)生多個(gè)結(jié)果。cellSens Dimension進(jìn)一步以cellSens standard的功能為基礎(chǔ)做了升級，提供包括Z-序列采集、自動(dòng)對焦和實(shí)時(shí)圖像的去模糊等功能。除了能夠控制第三方相機(jī)和光源外，還可以使用高級分析工具快速處理采集到的數(shù)據(jù)，然后輕松地發(fā)送到可定制的報(bào)告中，使報(bào)告編輯人可以很容易地直接使用Microsoft Word進(jìn)行編輯。此外，還具有被稱為“Solutions"的選配擴(kuò)展插件，以實(shí)現(xiàn)一些高級或其他特定的功能。
cellSens Dimension Desktop
離線處理和分析?？蓪⑷魏斡?jì)算機(jī)變?yōu)橐粋€(gè)處理和分析工作站。離線軟件包不包括顯微鏡成像系統(tǒng)，僅用來實(shí)現(xiàn)圖像處理和分析。
圖形化實(shí)驗(yàn)管理系統(tǒng) (GEM)
的圖形化實(shí)驗(yàn)管理系統(tǒng)(GEM)放棄了常見的基于面板的復(fù)雜界面，允許用戶簡單地在屏幕上“繪制"實(shí)驗(yàn)計(jì)劃，即可進(jìn)行復(fù)雜的成像。可以將圖標(biāo)與特定的“幀"組合使用，以實(shí)現(xiàn)多通道、Z-序列和延時(shí)采集的任何組合，還能在不同的樣本位置同時(shí)實(shí)施相同或不同的實(shí)驗(yàn)。可以在實(shí)驗(yàn)過程中設(shè)定用戶交互，以及如果需要，直接控制任何顯微鏡電動(dòng)部件。一次實(shí)驗(yàn)可以有多個(gè)輸出，從而避免了多次采集，并且與奧林巴斯實(shí)時(shí)控制器組合使用后，可以地同步外部設(shè)備的控制，以提高整個(gè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的靈活性。
多維成像
與電動(dòng)顯微鏡組合使用時(shí)，進(jìn)程管理系統(tǒng)很方便的采集多色和多維圖像。使用選配的多位點(diǎn)解決方案還可以自動(dòng)采集多點(diǎn)和大視野圖像。
多孔板導(dǎo)航器
多孔板導(dǎo)航器解決方案能夠依照不同的孔板樣式 (標(biāo)準(zhǔn)和定制) 自動(dòng)掃描并采集圖像。所有要求的圖像，包括位置和用戶備注都可以保存到系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫里，以便于訪問。可以按照行、列或任意方式為培養(yǎng)孔設(shè)置不同的成像條件。
還允許在單一孔板內(nèi)完成多個(gè)試驗(yàn)，設(shè)定更加了靈活性。
手動(dòng)多圖像拼接功能可以實(shí)時(shí)創(chuàng)建全景圖像。 采用cellSens Dimension和選配的多位點(diǎn)解決方案也可以自動(dòng)操作電動(dòng)載物臺進(jìn)行大視野成像。此功能還可以與電動(dòng)z軸對焦組合使用，圖像采集時(shí)，自動(dòng)校正樣本扭曲和傾斜。
用戶通過樣本緩慢對焦時(shí)記錄下圖像數(shù)據(jù)，EFI功能*能自動(dòng)創(chuàng)建一個(gè)全景對焦圖像。如果使用了電動(dòng)對焦顯微鏡，則可以自動(dòng)實(shí)現(xiàn)EFI處理。此類EFI功能，作為采集處理的一部分，或通過組合以前采集的多個(gè)Z-序列圖像來創(chuàng)建。
* 此功能需要 “Dimension"版本或帶“手動(dòng)處理"解決方案的“standard"軟件包。
光譜拆分
cellSens Dimension中使用了線性分離算法，可以隨時(shí)分離重疊在發(fā)射光譜里的熒光物質(zhì)—比如GFP和 YFP — ，以產(chǎn)生無串色的熒光圖像。這種線性分離工具也可以分離與自發(fā)熒光相關(guān)的背景。
反卷積
cellSens Dimension包括用于實(shí)時(shí)預(yù)覽和采集的實(shí)時(shí)2D去模糊功能，能夠?qū)駱?biāo)本進(jìn)行更好的對焦。此外，cellSens里具有更*的3D反卷積技術(shù)，重 新處理焦外信號。選配的CI反卷積解決方案使用了新的限制迭代算法，以行業(yè)的技術(shù)改善了分辨率、對比度和動(dòng)態(tài)范圍。
細(xì)胞系:人類宮頸癌細(xì)胞系HeLa細(xì)胞
免疫熒光染色:Hec1染色(綠色,Alexa- 488),a-微管蛋白染色(紅色,Alexa- 568),DAPI染色(藍(lán)色)
來源于人類宮頸癌的有絲分裂HeLa細(xì)胞。有絲分裂紡錘體與著絲粒分別用anti-a-tubulin(紅色)和anti-Hec1(綠色)抗體染色。通過著絲粒，染色體與微管相互作用構(gòu)成有絲分裂紡錘體,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)裝配在染色體的著絲粒區(qū)域。
圖像數(shù)據(jù)由日本東北大學(xué)癌癥發(fā)展研究所，分子腫瘤學(xué)系的Masanori Ikeda和Kozo Tanaka提供。
焦點(diǎn)提取
從圖像中提取焦點(diǎn)，包括Z-序列延時(shí)圖像。即使在眾多離焦延時(shí)圖像中，此功能也能以可能的焦平面創(chuàng)建T-系列圖像。
HDR功能以不同的曝光時(shí)間自動(dòng)采集多個(gè)圖像，通過這種方法創(chuàng)建具有更高的動(dòng)態(tài)范圍圖像，這種圖像可清晰地顯示低強(qiáng)度信號，又不會(huì)過度曝光樣本的明亮區(qū)域。
用于cellSens Dimension的相機(jī)解決方案
為滿足高級研究人員的需求，相機(jī)解決方案允許cellSens Dimension配置一些新的EM-CCD相機(jī)。相機(jī)控制面板增加一些其它的控制，允許在常規(guī)的cellSens界面中輕松地使用相機(jī)。
用于cellSens Dimension的設(shè)備解決方案
設(shè)備解決方案允許cellSens使用一些高級設(shè)備，比如影像分割器和量壓電動(dòng)Z軸設(shè)備，從而極大地提高采集速度。該解決方案可以控制Yokogawa CSU-X1轉(zhuǎn)盤共聚焦設(shè)備，允許cellSens用戶實(shí)時(shí)追蹤活樣本快速動(dòng)態(tài)的活動(dòng)，并采用奧林巴斯實(shí)時(shí)控制器獲取可靠的結(jié)果。
用于測量和分類的自動(dòng)目標(biāo)識別
采用計(jì)數(shù)和測量解決方案可以進(jìn)一步擴(kuò)展多種測量方式。cellsens軟件中廣泛的手動(dòng)測量功能可進(jìn)一步擴(kuò)展成計(jì)數(shù)和測量方案。在交互式界面識別目標(biāo)的自動(dòng)測量和分類總是與測量鏈接在一起。結(jié)果可以很方便的導(dǎo)出到Microsoft Excel中做進(jìn)一步分析。
宏管理器
可以使用宏命令來執(zhí)行典型的工作流程，比如從圖像采集到數(shù)據(jù)分析。
宏命令可以同時(shí)應(yīng)用到多幅圖像。
宏管理器可以極大地減少復(fù)雜成像和分析任務(wù)的工作時(shí)間。
圖像比較 (同步圖像窗口)
采用同步縮放和移動(dòng)并排顯示圖像，進(jìn)行精確比較。
手動(dòng)測量
cellSens提供了各種測量工具，包括點(diǎn)之間的距離、面積、強(qiáng)度測量和形態(tài)學(xué)參數(shù)。測量數(shù)據(jù)作為圖層保存，并可以導(dǎo)出到MS Excel和cellSens工作簿格式。
通過FRET或Ca2+成像獲取的多色圖像上簡單的設(shè)置感興趣區(qū)域（ROI）,就可以圖形方式描述強(qiáng)度和通道比率，并且可將數(shù)值導(dǎo)出到Excel或工作薄中。更精細(xì)的細(xì)胞結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)可通過使用比率顯示獲得清晰的展示，這要?dú)w功于強(qiáng)度調(diào)節(jié)顯示（IMD）功能，它能夠通過色調(diào)和亮度展示比率和強(qiáng)度。此外，ROI可以隨著細(xì)胞的移動(dòng)而移動(dòng)去捕捉測量，在線分析功能可作為選配插件。圖像處理功能插件可應(yīng)用于FRAP實(shí)驗(yàn)的圖像分析和曲線擬合。
動(dòng)目標(biāo)計(jì)數(shù)和分類 – 點(diǎn)擊計(jì)數(shù)
cellSens點(diǎn)擊計(jì)數(shù)功能允許研究人員進(jìn)行便捷的手動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)。點(diǎn)擊鼠標(biāo)標(biāo)記細(xì)胞或其它目標(biāo)，計(jì)數(shù)并自動(dòng)分配給用戶定義的目標(biāo)分類。為了完成進(jìn)一步的分析或文件記錄，cellSens能夠方便地將數(shù)據(jù)導(dǎo)出到MS excel。
只需簡單的拖拽操作即可使用便捷的報(bào)告工具將圖像與參數(shù)數(shù)據(jù)、測量數(shù)據(jù)和用戶定制文檔組合進(jìn)報(bào)告模板里。這些Microsoft Word*報(bào)告能夠?qū)崿F(xiàn)與同事的快速而輕松的合作，以及交流結(jié)果。
* 需要Microsoft Word version 2007或后續(xù)版本
數(shù)據(jù)庫
數(shù)據(jù)庫核心解決方案允許創(chuàng)建用戶定義的數(shù)據(jù)庫，具有的訪問控制權(quán)限，可以實(shí)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)共享。數(shù)據(jù)庫不但收集圖像，還包括所有相關(guān)的圖像參數(shù)、用戶評論和任何相關(guān)的文件，比如用于其它文件的電子表格。交互式查詢工具使其可以更容易地找到所需的數(shù)據(jù)，自動(dòng)預(yù)覽找到的圖像。使用數(shù)據(jù)庫客戶解決方案可以從不同的工作站便捷地查看和修改共享數(shù)據(jù)庫。
遠(yuǎn)程實(shí)時(shí)圖像
cellSens NetCam解決方案使用了標(biāo)準(zhǔn)的TCP/IP協(xié)議，能夠方便地用網(wǎng)絡(luò)傳送實(shí)時(shí)圖像和保存的圖像用于教學(xué)、監(jiān)視或監(jiān)督。因此，即使在實(shí)驗(yàn)室以外，同事或監(jiān)督員也可以從網(wǎng)絡(luò)上的任何點(diǎn)進(jìn)行監(jiān)視，從而提高了實(shí)驗(yàn)室的效率。
使用選配的“Solutions"可以將每個(gè)cellSens軟件包擴(kuò)展到的應(yīng)用。
| 功能 | Entry | Standard | Dimension |
|---|---|---|---|
| CI反卷積 | - | - | x |
| 多位點(diǎn) | - | - | x |
| 多孔板導(dǎo)航器 | - | - | x |
| 計(jì)數(shù)和測量 | - | - | x |
| 比率 | - | - | x |
| 圖片處理 | - | - | x |
| 數(shù)據(jù)庫核心 | - | x | x |
| Net Cam | - | x | x |
| 數(shù)據(jù)庫客戶端 | x | x | x |
| 多通道采集 | - | x | - |
| 手動(dòng)進(jìn)程 | - | x | - |
| 相機(jī) | - | - | x |
| 設(shè)備 | - | - | x |
*cellSens軟件不能應(yīng)用于全領(lǐng)域
黑色皮膚
黑色皮膚減少了計(jì)算機(jī)顯示器產(chǎn)成的環(huán)境光，使cellSens用戶可以適應(yīng)變暗的環(huán)境；圖標(biāo)保持高反差，以便于識別和快速選擇。
可定制的窗口布局
可以安排工具和窗口，以適合正在進(jìn)行的工作，優(yōu)化布局的功能。
所有常見的功能都集成在標(biāo)簽里，組合了所有相關(guān)的選項(xiàng)和設(shè)置。這些布局標(biāo)簽允許用戶根據(jù)特定的工作流程輕松地選擇想要功能。例如，在采集標(biāo)簽下顯示相機(jī)控制性能。切換到下一個(gè)進(jìn)程標(biāo)簽時(shí)，則從視圖去掉了這些顯示。
我的功能 -
cellSens使用戶可以為常用的功能創(chuàng)建并保存定制的工具欄，然后保存到我的功能窗口。
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