一直以來，科學(xué)家們都認(rèn)為癌癥是細(xì)胞水平上的單個(gè)克隆疾病，從進(jìn)化上來說，就是所謂的“成功”腫瘤細(xì)胞，就是能將其遺傳模板傳遞給下一代的腫瘤細(xì)胞。癌細(xì)胞包含能快速擴(kuò)散的惡性克隆，也就是說，這些是在生長腫瘤的宿主環(huán)境中zui適生長的克隆，分析這些克隆能有助于了解為什么癌癥如此頑固，難以治療，以及它們是如何在毒性療法中存活下來的。

單細(xì)胞測序方法即single cell sequencing（SNS），能準(zhǔn)確定量一個(gè)單細(xì)胞核中基因拷貝數(shù)目。由于癌細(xì)胞中基因組部分被刪除，或者擴(kuò)增，從而引起關(guān)鍵基因的缺失，或者表達(dá)過量，干擾正常細(xì)胞生長，因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目，從而診斷癌癥。
近年來這一研究領(lǐng)域成為了癌癥研究的熱點(diǎn)之一，3月2日出版的Cell雜志就以“Single-Cell Sequencing of Cancer”為題，介紹了本期中兩項(xiàng)單個(gè)癌細(xì)胞全外顯子測序的研究成果，這兩項(xiàng)成果分別是針對血液癌癥，和固體腎臟腫瘤展開的研究。

據(jù)介紹，在*篇“Single-Cell Exome Sequencing and Monoclonal Evolution of a JAK2-Negative Myeloproliferative Neoplasm”文章中，中國深圳華大基因研究院的研究人員，聯(lián)合西南大學(xué)，武漢大學(xué)等處的研究人員對取自一例典型的JAK2陰性ET病人的90個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行了全外顯子測序，通過諸多分析，研究人員揭示了此ET在腫瘤發(fā)生中遵循單克隆演化模型，并鑒定了一些與ET的發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的突變基因。
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第二篇文章“Single-Cell Exome Sequencing Reveals Single-Nucleotide Mutation Characteristics of a Kidney Tumor”則采用了一種新方法，對腎透明細(xì)胞癌進(jìn)行了研究。他們發(fā)現(xiàn)此例腎癌并非由常見的兩個(gè)突變基因VHL和PBRM1導(dǎo)致，這說明在病人群體中所鑒定的頻發(fā)突變（recurrent mutation）可能與腫瘤個(gè)體無關(guān)，同時(shí)也強(qiáng)調(diào)了在癌癥分析和診斷過程中進(jìn)行個(gè)性化治療的重要性。
通過遺傳學(xué)定量分析，研究人員發(fā)現(xiàn)在此腎癌中不存在明顯的克?。?xì)胞）亞群，而且在腫瘤細(xì)胞群體內(nèi)不同細(xì)胞突變頻率的突變之間也存在差異明顯的堿基突變譜，研究人員推測這可能與腫瘤演化過程中的選擇緊密相關(guān)。此外，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些與此腎癌發(fā)生相關(guān)的重要功能基因。

去年冷泉港實(shí)驗(yàn)室，德州大學(xué)MD Anderson癌癥研究中心的研究人員采用了一種稱為染色體斷點(diǎn)分析（chromosomal breakpoint analysis）的方法，來分析不同腫瘤細(xì)胞亞群之間的。但這一方法的局限是不能從單個(gè)核苷酸水平了解單個(gè)癌細(xì)胞的遺傳特性。
而研究則建立了一種基于多重置換擴(kuò)增（MDA）的單細(xì)胞測序新方法，并對該方法的擴(kuò)增均一性、靈敏度、特異性等方面進(jìn)行了全面評估。這種將多重置換擴(kuò)增（MDA）和測序技術(shù)相結(jié)合的單細(xì)胞測序方法不僅具有更高的分辨率和基因組覆蓋度，而且具有更好的敏感性和特異性。該方法從單核苷酸水平上為各種復(fù)雜疾病和生物學(xué)過程的研究開辟了新思路。

來源：生物通