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上海信裕生物科技有限公司

浙大Nature子刊解析RNA剪切調(diào)控

時間:2012-12-11閱讀:368
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可變剪接是產(chǎn)生蛋白質(zhì)和功能的多樣性的重要途徑,對細胞分化和發(fā)育以及疾病發(fā)生等至關(guān)重要。人類高達95%以上的基因是可變剪接的。這種可變剪接產(chǎn)生的產(chǎn)物數(shù)目是極其驚人的,如果蠅Dscam(唐氏綜合癥細胞黏附分子)基因通過互斥剪接可產(chǎn)生的異構(gòu)體多達38 016種,是其整個基因組基因數(shù)目的兩倍。

 

互斥剪切是一種受到嚴格調(diào)控的選擇性剪切形式,在這一機制中剪切機器必須從兩個或更多個盒式外顯子中選擇出一個納入一種信使RNA(mRNA)異構(gòu)體。zui有趣是研究人員發(fā)現(xiàn)互斥剪切模式涉及RNA二級結(jié)構(gòu)的競爭。這一機制zui初被發(fā)現(xiàn)存在于Dscam的第6外顯子簇中。近期研究人員在幾個互斥外顯子簇,包括Dscam第4和第9外顯子簇中也觀察到相似的結(jié)構(gòu)重排。

 

在這篇文章中,研究人員揭示了一個可以激活第6外顯子簇的基因座控制區(qū)域,并證實其結(jié)合停泊位點選擇器序列(docking site selector sequence,生物通譯)的相互作用,特異性允許僅僅選擇一個外顯子變異。通過對63個物種進行比較基因組研究,結(jié)合突變分析揭示了基因座控制區(qū)域內(nèi)存在一些復(fù)雜的串聯(lián)的多“亞單位”(subunit)RNA結(jié)構(gòu),這些結(jié)構(gòu)激活了物種適當?shù)倪x擇性變異體。而增強這些靶外顯子的弱剪切位點可以消除對基因座控制區(qū)域的依賴性。 

 

新研究不僅確定了一個可以激活第6外顯子簇的基因座控制區(qū)域,為我們提供了一個基因座控制區(qū)域依賴性互斥剪切機制,還揭示了一種RNA分子機器長期的復(fù)雜性增高的進化模式。由于Dscam基因與神經(jīng)和免疫功能等相關(guān),該研究成果對深入認識基因表達的調(diào)控機制,闡析疾病發(fā)生發(fā)展機制也具有十分重要的意義。

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